33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2133 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  222  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  67.59 
 
 		 108 aa  156  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  48 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  47 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  42.72 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  48.15 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  44.79 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  45.78 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  42.55 
 
 		 334 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  41.05 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  40.7 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03140  hypothetical protein  50.98 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  33.75 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  36.25 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  34.02 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  39.13 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 467 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  29.9 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 452 aa  42.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  31.18 
 
 		 682 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 279 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  28.26 
 
 		 569 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5443  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 2316 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.162158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 465 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 789 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 448 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>