36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3081 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  50 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  48.11 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  48.54 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  48 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  37.62 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  43.14 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  43.16 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  41.94 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03140  hypothetical protein  40.22 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  40.45 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  43.42 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  51.61 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 587 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  41.43 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  29.79 
 
 		 604 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  39.71 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  32.98 
 
 		 233 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0503  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1463  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  38.46 
 
 		 406 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1437  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  38.46 
 
 		 406 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.22 
 
 		 121 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  31.91 
 
 		 162 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 567 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3461  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  36.76 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  26.09 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 		 692 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  35.29 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 235 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>