49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3151 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  286  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  49.65 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  58.21 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  53.38 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  60 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  49.17 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  52.29 
 
 		 233 aa  100  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  51.85 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  38.74 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  39.25 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  39.08 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  38.1 
 
 		 584 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.37 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  29.29 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  40 
 
 		 334 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  30.95 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 697 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 697 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 1061 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 465 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  35.09 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  34.83 
 
 		 638 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.45 
 
 		 442 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.72 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  32.91 
 
 		 586 aa  42.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 878 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  32.97 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 563 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 935 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 775 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 700 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 251 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1999  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 417 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3385  tetratricopeptide  39.24 
 
 		 811 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 718 aa  40.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 574 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  24.74 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 620 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.35 
 
 		 290 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  29.09 
 
 		 677 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  29.06 
 
 		 1180 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  29.06 
 
 		 1172 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  29.06 
 
 		 1150 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 		 594 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.45 
 
 		 557 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 169 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>