More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2070 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3181  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.46 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385251  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.59 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 
263 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.22 
 
 
263 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
878 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 
632 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.41 
 
 
810 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
566 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.54 
 
 
887 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
789 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.37 
 
 
267 aa  72  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
515 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.7 
 
 
758 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  26.9 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.22 
 
 
725 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.01 
 
 
689 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.42 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
399 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
1714 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
3145 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 
2240 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1499  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.16 
 
 
494 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
543 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.85 
 
 
818 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 
784 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
1421 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.22 
 
 
988 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
1454 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
1451 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.57 
 
 
733 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63396  predicted protein  24.05 
 
 
551 aa  63.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
465 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
1038 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
295 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
927 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.35 
 
 
266 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.93 
 
 
1676 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.3 
 
 
290 aa  62  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
934 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 
576 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
1096 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.67 
 
 
1022 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.49 
 
 
594 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.63 
 
 
406 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.7 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.63 
 
 
406 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
475 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
366 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
1737 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.8 
 
 
1979 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.06 
 
 
340 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
923 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 
750 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
563 aa  60.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 
1056 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 
468 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
1276 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 
626 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
1069 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.04 
 
 
837 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
718 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.94 
 
 
1154 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.78 
 
 
586 aa  59.7  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
357 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
800 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
505 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2077  tetratricopeptide TPR_2  24.04 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 
3560 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  23.93 
 
 
539 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
374 aa  58.9  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.44 
 
 
406 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  27.5 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
615 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
828 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
3172 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.94 
 
 
1694 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.59 
 
 
746 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  23.6 
 
 
725 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.75 
 
 
626 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.75 
 
 
614 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>