154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0670 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 127 aa  247  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  67.52 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  49.55 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  44.66 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  43.75 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  41.96 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  43.36 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  42.72 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  44.21 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  49 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  48.08 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  43.42 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  40 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  42.35 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.41 
 
 		 293 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03140  hypothetical protein  42.39 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 344 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 344 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  35.14 
 
 		 336 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  31.07 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 405 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  39.8 
 
 		 550 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.77 
 
 		 863 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 364 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 289 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 399 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 689 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 505 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 436 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 1061 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  31.67 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  36.52 
 
 		 591 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  27.71 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.37 
 
 		 1838 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  29.13 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  30.59 
 
 		 519 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 245 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 4079 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 265 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 1694 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 878 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 880 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4222  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1757 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 		 1106 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 1451 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 594 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 245 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.42 
 
 		 632 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 467 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 1454 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  32.5 
 
 		 469 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  34.04 
 
 		 690 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.42 
 
 		 436 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.05 
 
 		 810 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  26.13 
 
 		 321 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 690 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  24.27 
 
 		 287 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 1534 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.73 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 520 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  25.93 
 
 		 375 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 556 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 864 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 502 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 722 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  30.95 
 
 		 545 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0316  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 257 aa  43.9  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.474202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 465 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 366 aa  43.9  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  33.33 
 
 		 889 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  35.96 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 		 2240 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 700 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 968 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 402 aa  43.5  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.29 
 
 		 626 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  30.84 
 
 		 647 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 		 442 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  34.09 
 
 		 538 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.42 
 
 		 1764 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 2262 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 542 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 714 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2787  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 311 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  32.58 
 
 		 573 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 		 444 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  34.85 
 
 		 415 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 1737 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4723  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29 
 
 		 887 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  31.17 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1481  MCP methyltransferase, CheR-type  32.98 
 
 		 513 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>