19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0316 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0316  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.474202 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15331  hypothetical protein  27.78 
 
 		 557 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  32.26 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2787  TPR repeat-containing protein  43.14 
 
 		 400 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3768  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.26 
 
 		 746 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0301  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 911 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  32.18 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 127 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1846  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.29 
 
 		 110 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.791736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.11 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.59 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 543 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.82 
 
 		 624 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 750 aa  42.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 190 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>