More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3768 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3768  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
299 aa  625  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  34.04 
 
 
573 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.76 
 
 
1056 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
824 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.34 
 
 
1274 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
878 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.08 
 
 
1022 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 
839 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.63 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.3 
 
 
810 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
649 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 
689 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
890 aa  65.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
523 aa  65.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 
818 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  30 
 
 
750 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
452 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
1276 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  32.28 
 
 
682 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 
1056 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
3035 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.15 
 
 
707 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 
240 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.93 
 
 
632 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.1 
 
 
836 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1421 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
927 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.25 
 
 
237 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
425 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  28.7 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
392 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 
833 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
718 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
833 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
465 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
828 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.9 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.84 
 
 
1013 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
732 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
754 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.9 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.3 
 
 
581 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  31.11 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
828 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  33.05 
 
 
1240 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.19 
 
 
738 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
762 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.96 
 
 
778 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
754 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.31 
 
 
576 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 
466 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 
2240 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.9 
 
 
706 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
833 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  26.52 
 
 
407 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
243 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
352 aa  58.9  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.7 
 
 
988 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.5 
 
 
1979 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.37 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.09 
 
 
542 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
613 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.37 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 
209 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.56 
 
 
1694 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.37 
 
 
887 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
409 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
595 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  33 
 
 
898 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
605 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
602 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
562 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
543 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
213 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
1737 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 
935 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.07 
 
 
746 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
619 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 
522 aa  57  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
687 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
402 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  27.86 
 
 
442 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.09 
 
 
1007 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.57 
 
 
357 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
3145 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.11 
 
 
764 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
161 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>