More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3022 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
161 aa  333  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  58.33 
 
 
156 aa  203  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.71 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.13 
 
 
156 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.49 
 
 
156 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  54.49 
 
 
156 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  51.28 
 
 
156 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  36.97 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 
219 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  33.59 
 
 
233 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  31.2 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  28.79 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 
226 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.45 
 
 
397 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  38.75 
 
 
224 aa  67.4  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
927 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
245 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
211 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
204 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
205 aa  62.4  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  38.96 
 
 
1694 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 
605 aa  61.6  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
628 aa  60.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
371 aa  60.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
1406 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 
202 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
194 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.55 
 
 
462 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 
687 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.18 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  36.71 
 
 
209 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  36.71 
 
 
229 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
452 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
761 aa  58.9  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
1276 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
200 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  34.15 
 
 
1979 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
290 aa  58.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.68 
 
 
560 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
230 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3768  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
299 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  34.44 
 
 
1013 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  30.21 
 
 
261 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.9 
 
 
439 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.58 
 
 
746 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  40.62 
 
 
439 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
425 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
543 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
244 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
743 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  32.58 
 
 
398 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
306 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
366 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
716 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
404 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
388 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
4079 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.47 
 
 
577 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
388 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
499 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
391 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 
314 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.71 
 
 
738 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
352 aa  53.9  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
389 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
356 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
301 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
392 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
1421 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
406 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
236 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
406 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 
289 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
284 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.9 
 
 
730 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
804 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  35.06 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  34.25 
 
 
458 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 
538 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21931  hypothetical protein  30.7 
 
 
387 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.94 
 
 
707 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
188 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
280 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
1192 aa  52.4  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  28.72 
 
 
295 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  28.72 
 
 
295 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
649 aa  52  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 
247 aa  52  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  29.21 
 
 
442 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.98 
 
 
706 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>