45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1846 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1846  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 110 aa  225  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.791736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 318 aa  50.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.29 
 
 		 758 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  32.35 
 
 		 407 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3768  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 299 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 543 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.19 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 927 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.71 
 
 		 941 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  34.18 
 
 		 1101 aa  43.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 409 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 833 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.85 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0316  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 257 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.474202 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 409 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 992 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 		 409 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.29 
 
 		 413 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 4079 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.2 
 
 		 836 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 605 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1969  tetratricopeptide TPR_2  27.06 
 
 		 172 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.467519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 750 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.58 
 
 		 941 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2216  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0829  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 		 394 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 833 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  34.18 
 
 		 815 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 366 aa  40.8  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1067  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 264 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 413 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 375 aa  40.4  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 288 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 		 917 aa  40  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 287 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 		 833 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>