273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0774 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0774  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1534 aa  2954    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  53.41 
 
 		 1445 aa  1249    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4222  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1757 aa  355  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.55 
 
 		 1838 aa  163  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 968 aa  67  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  27.04 
 
 		 1930 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 827 aa  65.5  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 3145 aa  61.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 486 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 632 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 828 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 689 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.66 
 
 		 810 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 722 aa  59.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1714 aa  59.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.67 
 
 		 1694 aa  58.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 878 aa  58.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00567  TAL effector AvrBs3/PthA  20.55 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109196  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05609  TAL effector AvrBs3/PthA  20.09 
 
 		 1017 aa  58.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000182939  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 750 aa  58.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 718 aa  58.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06229  TAL effector AvrBs3/PthA  19.63 
 
 		 904 aa  57.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00614737  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 3560 aa  57.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 156 aa  57.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05633  TAL effector AvrBs3/PthA  19.63 
 
 		 904 aa  57.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00212942  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.83 
 
 		 622 aa  57.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03922  TAL effector AvrBs3/PthA  19.63 
 
 		 1037 aa  57.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0433  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 254 aa  57.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.017119  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.39 
 
 		 546 aa  57.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.71 
 
 		 739 aa  57.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 522 aa  57.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  23.68 
 
 		 1101 aa  56.6  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 632 aa  57  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.4 
 
 		 764 aa  57  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.16 
 
 		 293 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 221 aa  56.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01085  TAL effector AvrBs3/PthA  20.09 
 
 		 983 aa  56.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000275966  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06234  TAL effector AvrBs3/PthA  20.09 
 
 		 983 aa  56.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00915225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 1737 aa  56.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02269  TAL effector AvrBs3/PthA  19.58 
 
 		 734 aa  56.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.046405  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 505 aa  56.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 156 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 		 1061 aa  55.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 344 aa  55.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.19 
 
 		 573 aa  55.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 448 aa  55.5  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 344 aa  55.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 		 892 aa  55.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.56 
 
 		 739 aa  55.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02172  TAL effector AvrBs3/PthA  19.59 
 
 		 1086 aa  55.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 828 aa  55.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 542 aa  54.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.74 
 
 		 1979 aa  55.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 156 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  19.72 
 
 		 1107 aa  54.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 156 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.38 
 
 		 887 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00223  TAL effector AvrBs3/PthA  20.41 
 
 		 1068 aa  53.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.91 
 
 		 573 aa  54.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  19.72 
 
 		 969 aa  53.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  30.21 
 
 		 224 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 377 aa  54.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  21.66 
 
 		 979 aa  54.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.78 
 
 		 742 aa  53.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  29.79 
 
 		 226 aa  53.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1085 aa  53.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  26.05 
 
 		 725 aa  53.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.6 
 
 		 707 aa  53.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1450 aa  53.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 654 aa  53.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 836 aa  53.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 		 247 aa  52.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 766 aa  52.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 247 aa  52.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.79 
 
 		 725 aa  52.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00572  TAL effector AvrBs3/PthA  19.63 
 
 		 1047 aa  52.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.7 
 
 		 863 aa  52.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 589 aa  52.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 784 aa  52.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  22.22 
 
 		 542 aa  52.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 3172 aa  52.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 		 818 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 1073 aa  52.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 		 220 aa  52.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 740 aa  52  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.2 
 
 		 1764 aa  52  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  19.55 
 
 		 1483 aa  51.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.69 
 
 		 739 aa  51.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1094 aa  51.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 234 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 713 aa  51.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.69 
 
 		 603 aa  52  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 566 aa  51.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.52 
 
 		 988 aa  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 448 aa  51.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 486 aa  50.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 		 1056 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 279 aa  50.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 		 565 aa  51.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>