More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4604 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  80.92 
 
 
545 aa  916    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  100 
 
 
545 aa  1114    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4312  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.64 
 
 
554 aa  359  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.14 
 
 
623 aa  196  9e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  35.1 
 
 
612 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.45 
 
 
598 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
612 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.02 
 
 
652 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.29 
 
 
650 aa  158  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  33.09 
 
 
638 aa  153  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.19 
 
 
593 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.39 
 
 
715 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.93 
 
 
579 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.26 
 
 
591 aa  150  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.07 
 
 
627 aa  147  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.01 
 
 
658 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.4 
 
 
602 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 
1479 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  34.15 
 
 
621 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  30.9 
 
 
703 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  30.63 
 
 
672 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.82 
 
 
632 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.25 
 
 
798 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  34.56 
 
 
951 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.75 
 
 
1205 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 
528 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.59 
 
 
584 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
862 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  29.64 
 
 
692 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
691 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 
651 aa  137  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  36.62 
 
 
617 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  32.65 
 
 
604 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.32 
 
 
627 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 
972 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
900 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.04 
 
 
602 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 
1078 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.35 
 
 
667 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
502 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
468 aa  135  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  32.73 
 
 
692 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  35.14 
 
 
618 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
625 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.91 
 
 
662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.19 
 
 
869 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.62 
 
 
1373 aa  133  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.72 
 
 
528 aa  133  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 
973 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.89 
 
 
587 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  31.51 
 
 
656 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2579  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41999  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
1435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
562 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
666 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  29.62 
 
 
641 aa  131  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  32.38 
 
 
620 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  32.49 
 
 
623 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 
451 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 
614 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.09 
 
 
757 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
891 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
646 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
657 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  32.9 
 
 
623 aa  130  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6223  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.13 
 
 
994 aa  130  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
657 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
657 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
657 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 
1085 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.35 
 
 
603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.53 
 
 
1609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  29.49 
 
 
1330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
657 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.32 
 
 
613 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
642 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.69 
 
 
653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
569 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.54 
 
 
647 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.16 
 
 
657 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.62 
 
 
641 aa  127  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 
338 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 
1415 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  35.12 
 
 
1053 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
657 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
746 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1136  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.78 
 
 
486 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.97 
 
 
1242 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 
653 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.94 
 
 
1262 aa  127  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  33.14 
 
 
654 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 
368 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.6 
 
 
1036 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2182  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.76 
 
 
1060 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.06 
 
 
681 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>