33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0436 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0436  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.0000856563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  87.5 
 
 		 120 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0904  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  55.86 
 
 		 334 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3081  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298167  normal  0.458032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3305  hypothetical protein  48.94 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32270  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265116  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0578  hypothetical protein  49.49 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.67116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2133  hypothetical protein  47 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0670  TPR repeat-containing protein  41.96 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2037  hypothetical protein  43.56 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0732088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3982  DSBA oxidoreductase  47.87 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4164  hypothetical protein  46.24 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  42.02 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5189  DSBA oxidoreductase  46.99 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6063  hypothetical protein  35.4 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3151  hypothetical protein  41.46 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.876304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1748  tetratricopeptide domain-containing protein  35.85 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00737181  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3164  hypothetical protein  36.17 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0427407  normal  0.28931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2017  hypothetical protein  38.89 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2165  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00018031  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03140  hypothetical protein  41.76 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3016  tetratricopeptide domain-containing protein  36.44 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1251  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3215  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.17 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 264 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  25.71 
 
 		 467 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.79 
 
 		 883 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.17 
 
 		 602 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1194  Tetratricopeptide domain protein  30 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 4079 aa  40.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 610 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  31 
 
 		 573 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>