90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1194 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1194  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  28.18 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 732 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  27.5 
 
 		 581 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  26.78 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 927 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 634 aa  52  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 566 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.04 
 
 		 471 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 331 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 280 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  26.83 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  25.43 
 
 		 539 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.32 
 
 		 706 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  28.14 
 
 		 582 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 363 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.95 
 
 		 462 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 428 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 		 363 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 422 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.04 
 
 		 706 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 594 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  40.68 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 465 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 306 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.93 
 
 		 406 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.93 
 
 		 406 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 750 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3141  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 		 317 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286611  normal  0.0160397 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 306 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.32 
 
 		 784 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1297 aa  46.2  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0366  hypothetical protein  30.85 
 
 		 120 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.34 
 
 		 373 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 718 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 1129 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 446 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 502 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.68 
 
 		 818 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 394 aa  45.1  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5440  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 605 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 352 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.31 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 421 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  30.17 
 
 		 390 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 1421 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.31 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 617 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 592 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 592 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  31.58 
 
 		 1837 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 349 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 308 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 		 593 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 		 1056 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 617 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.03 
 
 		 738 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 409 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 1979 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 515 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 404 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63418  predicted protein  27.36 
 
 		 404 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316998  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 371 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 264 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 648 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 363 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  25.51 
 
 		 191 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 458 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  32.26 
 
 		 573 aa  41.6  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  34.67 
 
 		 301 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  35.59 
 
 		 1154 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 		 357 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 4079 aa  41.2  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.41 
 
 		 1007 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>