70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1046 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  99.64 
 
 		 275 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  90.91 
 
 		 275 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  63.73 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  60.5 
 
 		 280 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  62.99 
 
 		 280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  75.47 
 
 		 295 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  76.44 
 
 		 311 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  76.44 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  76.44 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  76.44 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  76.44 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  76.44 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  76.44 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  62.15 
 
 		 284 aa  274  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  62.6 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  40.44 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  40.53 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  41.8 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.11 
 
 		 307 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.11 
 
 		 307 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.64 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  39.37 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  43.56 
 
 		 343 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.94 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  33.94 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 237 aa  92.8  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  35 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  31.79 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  31.96 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  28.4 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  28.63 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  29.67 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  31.36 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 613 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 1737 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  30.72 
 
 		 613 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 607 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 409 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  33.97 
 
 		 607 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 607 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 607 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 409 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 409 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  28.85 
 
 		 205 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 607 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1194  Tetratricopeptide domain protein  40.68 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 566 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 2240 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 613 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.91 
 
 		 733 aa  45.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 821 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 776 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 776 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 776 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 607 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 607 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 512 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 776 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 821 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.29 
 
 		 818 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 776 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 716 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 592 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.45 
 
 		 1056 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.06 
 
 		 545 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>