More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0360 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 160 aa  328  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  46.61 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 153 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  41.59 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  39 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  37.11 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  25.93 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  36.47 
 
 		 1764 aa  58.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.33 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 1737 aa  57.4  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0928  calcium-binding EF-hand  30.11 
 
 		 431 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  37.35 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.01 
 
 		 708 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 1094 aa  54.7  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 594 aa  54.3  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.28 
 
 		 810 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 1252 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 878 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 1252 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 499 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 589 aa  53.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.56 
 
 		 391 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1535  Tetratricopeptide domain protein  39.18 
 
 		 322 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 313 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1079 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1276 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  34.29 
 
 		 1078 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 632 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.29 
 
 		 1078 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 1212 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.23 
 
 		 988 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 243 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.73 
 
 		 265 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  30.12 
 
 		 519 aa  52  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 827 aa  52  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.74 
 
 		 689 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  29.79 
 
 		 542 aa  51.6  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 		 190 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 248 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 208 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 649 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.97 
 
 		 207 aa  51.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 389 aa  50.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  34.58 
 
 		 882 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.72 
 
 		 758 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.14 
 
 		 560 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 931 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  34.58 
 
 		 882 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 425 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.75 
 
 		 436 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.68 
 
 		 339 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5172  hypothetical protein  30.61 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163802  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  30.43 
 
 		 648 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  36.08 
 
 		 632 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 1451 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 828 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.24 
 
 		 729 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 1454 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.72 
 
 		 725 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 456 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 243 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 392 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 722 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1029  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.73 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 542 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  34.15 
 
 		 266 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 4079 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0407  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644736  normal  0.04042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  36.59 
 
 		 725 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3688  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 279 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 404 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.94 
 
 		 733 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 200 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  29.89 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  34.04 
 
 		 222 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 4489 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 409 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1853  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 502 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00620569  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3096  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.44 
 
 		 366 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0496806  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2398  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 287 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 265 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>