More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1209 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  92.49 
 
 		 1078 aa  1772    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  100 
 
 		 1079 aa  2048    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  92.4 
 
 		 1078 aa  1746    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  37.24 
 
 		 983 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  36.47 
 
 		 991 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  36.9 
 
 		 982 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  34.13 
 
 		 1017 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  34.37 
 
 		 836 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  35.45 
 
 		 876 aa  301  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  34.7 
 
 		 844 aa  293  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  31.75 
 
 		 749 aa  292  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  35.09 
 
 		 842 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  35.51 
 
 		 830 aa  265  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  31.88 
 
 		 782 aa  248  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  29.55 
 
 		 803 aa  225  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  34.03 
 
 		 835 aa  221  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  29.87 
 
 		 819 aa  217  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  29.63 
 
 		 837 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  29.81 
 
 		 758 aa  193  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  32.42 
 
 		 903 aa  188  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  37.95 
 
 		 1040 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  30.01 
 
 		 875 aa  174  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  30.72 
 
 		 759 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  32.06 
 
 		 753 aa  136  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  31.38 
 
 		 765 aa  134  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  29.48 
 
 		 765 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  27.2 
 
 		 527 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  22.5 
 
 		 508 aa  98.6  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  25.3 
 
 		 498 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  27.54 
 
 		 521 aa  92.8  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.8 
 
 		 533 aa  87.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  22.99 
 
 		 516 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  37.5 
 
 		 522 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  24.83 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  28.5 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 878 aa  85.1  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  37.66 
 
 		 287 aa  84.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  24.49 
 
 		 504 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.83 
 
 		 810 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  24.49 
 
 		 504 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  24.49 
 
 		 504 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  31.4 
 
 		 523 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  24.57 
 
 		 536 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  32.12 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  36.24 
 
 		 287 aa  82.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  37.33 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  37.33 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  25.63 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  24.7 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  31.73 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  30.1 
 
 		 291 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  29.01 
 
 		 607 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  34.9 
 
 		 296 aa  80.1  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  34.9 
 
 		 296 aa  80.1  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  34.9 
 
 		 296 aa  80.1  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  25.57 
 
 		 521 aa  80.1  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  24.47 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  29.82 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  28.95 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  31.41 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  25.77 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  27.72 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  27.9 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  24.59 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  30.51 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  34.34 
 
 		 550 aa  77.4  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  25.45 
 
 		 525 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  21.8 
 
 		 558 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  27.03 
 
 		 533 aa  77.4  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  24.29 
 
 		 529 aa  77.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  26.33 
 
 		 503 aa  77.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  30.46 
 
 		 289 aa  77.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  31.61 
 
 		 288 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  31.61 
 
 		 288 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  27.3 
 
 		 499 aa  77  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  31.61 
 
 		 288 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  27.91 
 
 		 528 aa  77.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  31.61 
 
 		 288 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  31.61 
 
 		 288 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  27.09 
 
 		 302 aa  77  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  31.61 
 
 		 288 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  36.24 
 
 		 287 aa  77  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  28.15 
 
 		 502 aa  77  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  31.61 
 
 		 288 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  31.61 
 
 		 288 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  30.6 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  26.29 
 
 		 541 aa  76.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  32.89 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  36.76 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  24.77 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  24.77 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  34.48 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  32.21 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  26.96 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  25.41 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  31.03 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  31.61 
 
 		 286 aa  74.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  31.61 
 
 		 286 aa  74.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  29.28 
 
 		 304 aa  73.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>