More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3503 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  100 
 
 		 520 aa  1014    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  41.83 
 
 		 508 aa  362  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  41.35 
 
 		 498 aa  358  9e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  41.4 
 
 		 499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  41.13 
 
 		 503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  40.9 
 
 		 536 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  40.27 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  40.54 
 
 		 533 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  41.24 
 
 		 528 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  42.56 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  39.81 
 
 		 527 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  40.23 
 
 		 521 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  39.61 
 
 		 521 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  44.74 
 
 		 520 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  42.21 
 
 		 538 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  39.76 
 
 		 503 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  41.03 
 
 		 510 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  40.34 
 
 		 525 aa  309  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  39.45 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  39.45 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  44.53 
 
 		 520 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  44.53 
 
 		 520 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  39.4 
 
 		 510 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  42.44 
 
 		 522 aa  303  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  43.58 
 
 		 519 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  43.66 
 
 		 521 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  40.12 
 
 		 504 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  39.96 
 
 		 504 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  39.5 
 
 		 504 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  39.5 
 
 		 504 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  39.5 
 
 		 504 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  38.49 
 
 		 504 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  39.21 
 
 		 567 aa  289  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  38.05 
 
 		 514 aa  286  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  41.8 
 
 		 523 aa  282  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  35.46 
 
 		 510 aa  280  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  36.28 
 
 		 529 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  29.88 
 
 		 570 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  27.89 
 
 		 568 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  30.67 
 
 		 571 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  29.87 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  29.9 
 
 		 574 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  29.87 
 
 		 574 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  29.71 
 
 		 574 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  40.47 
 
 		 289 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  29.15 
 
 		 574 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  30.28 
 
 		 566 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  39.57 
 
 		 363 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  40.93 
 
 		 291 aa  144  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  28.36 
 
 		 574 aa  143  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  40.09 
 
 		 375 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  37.83 
 
 		 360 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  29.47 
 
 		 577 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  29.04 
 
 		 576 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  38.26 
 
 		 360 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  38.26 
 
 		 360 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  38.26 
 
 		 360 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  28.96 
 
 		 577 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  37.68 
 
 		 291 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  29.27 
 
 		 577 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  39.72 
 
 		 369 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  29.54 
 
 		 586 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  38.26 
 
 		 405 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  29.22 
 
 		 595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  28.05 
 
 		 575 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  28.34 
 
 		 575 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  39.17 
 
 		 303 aa  133  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  36.28 
 
 		 304 aa  131  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  38.39 
 
 		 305 aa  131  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  36.15 
 
 		 289 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  38.31 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  40 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  27.07 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  31.46 
 
 		 310 aa  116  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  35.36 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  35.36 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  35.36 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  35.36 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  32.34 
 
 		 283 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  35.36 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  35.36 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  35.36 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  33.98 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  34.48 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  34.92 
 
 		 287 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  37.79 
 
 		 375 aa  113  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  35.45 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  36.63 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  33.2 
 
 		 281 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  30.68 
 
 		 301 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  34.48 
 
 		 285 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  29.62 
 
 		 283 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  34.48 
 
 		 285 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  31.36 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  33.72 
 
 		 295 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  31.88 
 
 		 280 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  32.43 
 
 		 283 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  26.3 
 
 		 308 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.89 
 
 		 1078 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  36.41 
 
 		 277 aa  107  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>