298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0284 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  75.78 
 
 		 291 aa  471  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  74.39 
 
 		 291 aa  462  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  74.74 
 
 		 289 aa  460  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  55.36 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  44.72 
 
 		 291 aa  262  6e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  42.2 
 
 		 304 aa  222  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  41.47 
 
 		 304 aa  209  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  41.73 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  38.31 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  40.86 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  39.92 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  43.54 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  41.09 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  35.46 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  38.27 
 
 		 275 aa  188  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  40.68 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  38.24 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  39.92 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  37.27 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  37.27 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  35.93 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  37.13 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  37.83 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  36.98 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  37.74 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  34.88 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  38.52 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  39.21 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  37.69 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  37.74 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  37.74 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  37.74 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  37.74 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  37.74 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  37.74 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  37.69 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  36.9 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  36.94 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  33.57 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  37.04 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  36.98 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0886  spermidine synthase  43.31 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  36.23 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  38.28 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  37.93 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  34.05 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  35.42 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  37.5 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  37.55 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  35.69 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  33.69 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  35.38 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  38.37 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  38.37 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  38.37 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  34.34 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  36.06 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  36.82 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  37.21 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  39.47 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  35.74 
 
 		 275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  34.72 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  35.74 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  35.74 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  35.74 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  35.74 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  35.74 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  35.74 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  35.74 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  35.47 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  35.74 
 
 		 275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  34.8 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  35.38 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  35.09 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  35.84 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0744  spermidine synthase  36.61 
 
 		 431 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  37.2 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  35.02 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  35.38 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  32.37 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  34.98 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  36.57 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  34.72 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  34.78 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  32.73 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  37.08 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  32.73 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  32.73 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  36.3 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  32.37 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  33.7 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  32.37 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  33.33 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  32 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  32 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  32 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  32 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  32 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  32 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>