252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0699 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  77.42 
 
 		 574 aa  858    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  76.52 
 
 		 574 aa  835    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  75.62 
 
 		 595 aa  865    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  75.89 
 
 		 576 aa  859    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  77.24 
 
 		 574 aa  853    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  100 
 
 		 566 aa  1149    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  77.24 
 
 		 574 aa  853    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  75.27 
 
 		 575 aa  837    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  76.52 
 
 		 577 aa  846    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  76.88 
 
 		 577 aa  850    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  76.52 
 
 		 574 aa  838    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  77.98 
 
 		 586 aa  859    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  76.7 
 
 		 577 aa  848    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  62.91 
 
 		 571 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  77.41 
 
 		 575 aa  871    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  77.42 
 
 		 574 aa  858    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  56.38 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  55.99 
 
 		 568 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  31.04 
 
 		 508 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  32.61 
 
 		 515 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  31.26 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  32.38 
 
 		 521 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  29.7 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  32.5 
 
 		 528 aa  226  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  32.97 
 
 		 533 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  30.4 
 
 		 519 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  32.2 
 
 		 503 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  32.91 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  32.73 
 
 		 504 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  32.73 
 
 		 504 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  30.35 
 
 		 510 aa  220  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  32.74 
 
 		 499 aa  220  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  31.13 
 
 		 527 aa  220  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  30.95 
 
 		 521 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  32.01 
 
 		 504 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  32.01 
 
 		 504 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  32.01 
 
 		 504 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  30.58 
 
 		 521 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  32.23 
 
 		 528 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  31.91 
 
 		 503 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  29.51 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  30.58 
 
 		 525 aa  203  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  30.58 
 
 		 510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  30.8 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  31.23 
 
 		 525 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  31.23 
 
 		 525 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  26.21 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  28.4 
 
 		 529 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  29.28 
 
 		 567 aa  182  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  29.7 
 
 		 522 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  30.89 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  30.89 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  30.06 
 
 		 520 aa  173  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  32.88 
 
 		 523 aa  170  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  29.54 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  36.23 
 
 		 363 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  33.91 
 
 		 360 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  33.91 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  35.88 
 
 		 360 aa  143  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  33.56 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  33.91 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  33.56 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  35.07 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  33.33 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  31.76 
 
 		 304 aa  117  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  32.33 
 
 		 291 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  31.98 
 
 		 308 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  32.19 
 
 		 305 aa  109  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  30.74 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  31.56 
 
 		 291 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  32.21 
 
 		 283 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  29.54 
 
 		 283 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  29.05 
 
 		 310 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  32.69 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  32.43 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  31.93 
 
 		 328 aa  104  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  28.63 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  30.83 
 
 		 288 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  31.47 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  28.57 
 
 		 308 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  28.57 
 
 		 308 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  28.37 
 
 		 290 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  31.62 
 
 		 301 aa  99.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  27.85 
 
 		 285 aa  100  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  33.18 
 
 		 283 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  30.58 
 
 		 277 aa  98.2  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  30.67 
 
 		 292 aa  98.2  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  28.27 
 
 		 279 aa  97.4  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  31.35 
 
 		 375 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  33.17 
 
 		 290 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  28.57 
 
 		 283 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  30.52 
 
 		 349 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  31.37 
 
 		 293 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  30.04 
 
 		 277 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  25.91 
 
 		 286 aa  94.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  29.67 
 
 		 287 aa  94  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  25.55 
 
 		 283 aa  94.4  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  25.55 
 
 		 283 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  27.78 
 
 		 295 aa  93.2  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  32.06 
 
 		 285 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>