262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0383 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  45.16 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  44.72 
 
 		 289 aa  262  6e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  44.37 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  42.96 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  44.94 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  40.15 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  40.65 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  39.68 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  34.67 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  35.45 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  33.7 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  33.33 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  36.76 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  36.96 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  34.77 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  35.96 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  33.83 
 
 		 288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  33.46 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  33.46 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  33.46 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  33.46 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  33.46 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  33.46 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  33.46 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  33.46 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  33.46 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  33.46 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  33.46 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  33.46 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  32.21 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  33.56 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  33.56 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  33.46 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  31.09 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  33.33 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  37.14 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  31.85 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  33.33 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  33.08 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  35.19 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  31.48 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  32.83 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  29.24 
 
 		 275 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  33.33 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  34.7 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  31.84 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  31.84 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  31.84 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  31.84 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  32.98 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  33.46 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  30.45 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  33.85 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  35.02 
 
 		 375 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  31.18 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  34.6 
 
 		 349 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  32.83 
 
 		 277 aa  146  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0273  spermidine synthase  35.41 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000512429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  32.55 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  30.22 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  28.83 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  32.16 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  31.5 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1964  spermidine synthase  32.71 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.569543  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  30.22 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  32.34 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  38.03 
 
 		 519 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  29.03 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  30.8 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  27.04 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  29.59 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  30.43 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  30.43 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  39.91 
 
 		 521 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  29.71 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  30.71 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  37.71 
 
 		 538 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  30.94 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  29.53 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  29.53 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  37.07 
 
 		 528 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  29.18 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  37.09 
 
 		 533 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  30.51 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  28.29 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  35.24 
 
 		 522 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  27.99 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  28.02 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  30.34 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  27.92 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  27.92 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  27.61 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0073  spermidine synthase  29.71 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  27.61 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  27.61 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  35.98 
 
 		 515 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  29.17 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  28.4 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  28.4 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>