More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0529 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  100 
 
 		 283 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  99.29 
 
 		 283 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  83.8 
 
 		 284 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  72.7 
 
 		 286 aa  434  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  67.74 
 
 		 283 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  50 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  46.26 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  45.2 
 
 		 277 aa  270  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  47.31 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  47.31 
 
 		 277 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  47.31 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  43.73 
 
 		 275 aa  267  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  45.88 
 
 		 275 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  45.85 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  49.82 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  45.16 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  45.82 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  45.16 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  44.8 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  45.68 
 
 		 279 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  45.99 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  252  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  252  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  252  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  252  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  46.04 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  41.55 
 
 		 307 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  43.17 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  45.65 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  46.01 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  40.94 
 
 		 275 aa  245  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  41.67 
 
 		 279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  43.73 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  41.37 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  41.22 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  43.37 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  41.61 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  40.51 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  41.73 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  40.51 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  40.98 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  38.27 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  41.35 
 
 		 286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  41.6 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  40.36 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  40 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  40 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  40.49 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  36.46 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  39.65 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  38.95 
 
 		 287 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  39.65 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  38.93 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  40.07 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  40.07 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  40.07 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  40.07 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  37.97 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  40.07 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  40.43 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  40.43 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  40.43 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  40.43 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  40.43 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  40.43 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  40.43 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  40.43 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  40.07 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2930  spermidine synthase  39.78 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  39.49 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  39.36 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1389  spermidine synthase  41.13 
 
 		 284 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1964  spermidine synthase  37.64 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.569543  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  36.06 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  38.38 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  35.44 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  35.97 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0886  spermidine synthase  40.6 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  38.75 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  35 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  37.41 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  35.46 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  35.34 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  35.38 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0120  spermidine synthase  36.27 
 
 		 285 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0292397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  40.77 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3769  spermidine synthase  36.07 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  40.77 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  38.85 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0105  spermidine synthase  35.92 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.381293  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  34.4 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  34.4 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  35.47 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  33.92 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0273  spermidine synthase  37.22 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000512429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>