268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2046 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  100 
 
 		 285 aa  597  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  65.45 
 
 		 283 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  64 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  64.62 
 
 		 283 aa  364  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  59.01 
 
 		 293 aa  359  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  60.93 
 
 		 292 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0073  spermidine synthase  60.44 
 
 		 286 aa  343  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.116459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  63.18 
 
 		 278 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  63.18 
 
 		 316 aa  341  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0105  spermidine synthase  55.79 
 
 		 285 aa  334  9e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.381293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03650  spermidine synthase  56.64 
 
 		 285 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0120  spermidine synthase  55.44 
 
 		 285 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0292397  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3769  spermidine synthase  55.12 
 
 		 283 aa  329  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  56.36 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  40.57 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  41.88 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  43.12 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  41.88 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  44.44 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  40.5 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  40.79 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  41.22 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  40.5 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  41.73 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  40.22 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  43.28 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  41.13 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  41.75 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  41.82 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  36.75 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  40.59 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  41.39 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  38.57 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  39.01 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  40 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  36.65 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  36.65 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  36.3 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  41.39 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  36.65 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  38.04 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  37.32 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  37.1 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  37.68 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  36.01 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  37.68 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  37.68 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  37.68 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  37.68 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  37.68 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  37.68 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  41.01 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  37.68 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  34.15 
 
 		 283 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  37.32 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  37.32 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  34.4 
 
 		 283 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  37.54 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  36.79 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  35.13 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  34.28 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  38.61 
 
 		 280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  38.08 
 
 		 748 aa  182  6e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  35.21 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  40.49 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  35.16 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0886  spermidine synthase  38.31 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  35.74 
 
 		 271 aa  175  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  36.01 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  36.3 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  35.79 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  36.12 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  36.36 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  35.03 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  39.62 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  38.38 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  36.74 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26437  Spermidine synthase  35.84 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.047075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  33.9 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  33.93 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  36.36 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  36.36 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  36.36 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  36.36 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  36.36 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  36.36 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  36.36 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  35.98 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  35.59 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  36.36 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  35.27 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  34.84 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  31.63 
 
 		 316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  36.36 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2930  spermidine synthase  34.41 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  36.36 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  36.36 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  32.86 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2169  spermidine synthase  38.21 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  36.36 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>