More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2229 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  81.72 
 
 		 280 aa  481  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  76.98 
 
 		 286 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21581  spermidine synthase  58.63 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18161  spermidine synthase  60.93 
 
 		 290 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1286  spermidine synthase  58.63 
 
 		 288 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  61.73 
 
 		 286 aa  344  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  48.03 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  47.84 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  46.76 
 
 		 283 aa  316  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18761  spermidine synthase  47.67 
 
 		 283 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0918674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  49.45 
 
 		 283 aa  244  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  40.44 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  39.51 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  44.34 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  37.11 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  36.86 
 
 		 280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  37.76 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  34.42 
 
 		 277 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  35.85 
 
 		 280 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  35.98 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  42.05 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  39.62 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  35.46 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  37.99 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  35.11 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0105  spermidine synthase  38.28 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.381293  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0120  spermidine synthase  38.28 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0292397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  36.11 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  44.07 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  35 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  36.4 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  36.69 
 
 		 279 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  35.79 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  36.4 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  36.15 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  33.93 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  40.16 
 
 		 284 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  38.85 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  32.97 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  38.27 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  35.19 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  35.77 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03650  spermidine synthase  39.83 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  36.86 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  34.78 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  40.35 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  40.35 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  33.09 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  33.09 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  33.09 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  33.09 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  33.09 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  33.09 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  33.09 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  33.09 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  34.69 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3769  spermidine synthase  36.76 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  32.74 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  32.74 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  32.74 
 
 		 296 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  33.58 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  35.8 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  35.34 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  32.73 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  37.73 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  34.21 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  34.06 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  33.7 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  33.7 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  33.7 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  33.7 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  33.84 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  33.21 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  34.98 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  34.09 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  34.96 
 
 		 286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  39.34 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  38.26 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  32.84 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  38.43 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  35.78 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  36.88 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  32.62 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  31.97 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  37.61 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  32.27 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  37.95 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  33.59 
 
 		 286 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  31.11 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  38.82 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  41.48 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  41.48 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  38.4 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  38.4 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  38.82 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  38.4 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  38.4 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  38.4 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  37.74 
 
 		 293 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>