More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1286 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1286  spermidine synthase  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21581  spermidine synthase  93.38 
 
 		 288 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  60.35 
 
 		 286 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18161  spermidine synthase  67.14 
 
 		 290 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  58.63 
 
 		 279 aa  384  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  57.76 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  52.86 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  52.36 
 
 		 283 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  52.35 
 
 		 283 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  49.46 
 
 		 286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18761  spermidine synthase  53.02 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0918674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  38.89 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  33.21 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  41.01 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  36.52 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  31.9 
 
 		 284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  35.55 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  33.21 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  35.55 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  33.82 
 
 		 277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  35.16 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  37.84 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  34.51 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  34.5 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  34.77 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  33.33 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  38.56 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  33.57 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  35.38 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  35.14 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  30.94 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  34.77 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  30.94 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  34.35 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  32.16 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  32.99 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  33.21 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  34.23 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  35.45 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  35.45 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  35.66 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0120  spermidine synthase  31.16 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0292397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  36.94 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  32.25 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  32.25 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  41.76 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  34.58 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  41.21 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0105  spermidine synthase  30.82 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.381293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  34.31 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  34.31 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  34.04 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  34.31 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  39.9 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  34.31 
 
 		 275 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  32.58 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  31.87 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  37.56 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  33.21 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  33.94 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  33.94 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  33.94 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  33.94 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  30.29 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  33.94 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  33.94 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  33.94 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  36.96 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  28.82 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  28.82 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  28.82 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  28.82 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  28.82 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  28.82 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  28.82 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  32.27 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  28.82 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  32.03 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  36.86 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  32.69 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  35.97 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  30.89 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  35.84 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  35.8 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  27.78 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  27.78 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  27.78 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03650  spermidine synthase  30.14 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  28.47 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  27.78 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  27.78 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  30.12 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  28.12 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2930  spermidine synthase  40 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  30.12 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  30.12 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  31.66 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  36.86 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  29.32 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  29.92 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>