296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0564 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  83.97 
 
 		 290 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  69.5 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  69.5 
 
 		 285 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  68.44 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  68.44 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  68.44 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  68.44 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  68.79 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  65.6 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  65.6 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  65.6 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  65.6 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  65.6 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  65.6 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  65.25 
 
 		 285 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  65.25 
 
 		 285 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0744  spermidine synthase  51.87 
 
 		 431 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  49.45 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  41.24 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  46.01 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  46.38 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2981  spermidine synthase  46.15 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  35.52 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  34.96 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  35.13 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  33.57 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  36 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  37.2 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  34.94 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  32.82 
 
 		 310 aa  165  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  37.64 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  35.8 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  32.21 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  31.56 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  34.96 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  33.6 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  37.2 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  41.82 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  33.83 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  36.17 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  35.32 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  34.23 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  35.32 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  31.95 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  33.98 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  32.22 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  29.43 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  35.16 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  33.98 
 
 		 280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  32.4 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  37.89 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  35.88 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  31.87 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  37.5 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  33.33 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  31.66 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  32.26 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  33.7 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  31.52 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  31.52 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  36.65 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  31.67 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  33.49 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  32.52 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  33.84 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  32.52 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  32.52 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  31.27 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  33.46 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  33.33 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  31.94 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  31.9 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  29.96 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  33.46 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  32.21 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  33.46 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  31.25 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  35.24 
 
 		 281 aa  146  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  36.36 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  32.03 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  30.91 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  39.07 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  37.74 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  33.02 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  36.68 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  36.05 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  31.48 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  31.64 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  31.64 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  31.64 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  31.02 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0120  spermidine synthase  31.3 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0292397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  31.64 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  31.64 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  31.64 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  31.64 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  29.43 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  31.64 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  32.31 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>