More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1964 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1964  spermidine synthase  100 
 
 		 291 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.569543  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  64.98 
 
 		 291 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  65.34 
 
 		 286 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  62.59 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  64.98 
 
 		 286 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  61.05 
 
 		 296 aa  384  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  59.44 
 
 		 287 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  59.79 
 
 		 287 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  63.21 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  60.7 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  60.7 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  59.72 
 
 		 287 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  62.86 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  59.65 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  59.65 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  59.65 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  59.65 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  60 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  59.65 
 
 		 286 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  59.3 
 
 		 288 aa  374  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  59.65 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  59.65 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  59.65 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  59.65 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  59.65 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  59.65 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  59.65 
 
 		 286 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  61.73 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  60.07 
 
 		 289 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0273  spermidine synthase  56.73 
 
 		 276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000512429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  54.21 
 
 		 290 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1389  spermidine synthase  52.38 
 
 		 284 aa  295  6e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  47.67 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  49.64 
 
 		 287 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  45.91 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  42.76 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  42.37 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  37.64 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  37.27 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  39.78 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  37.13 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  39.34 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  37.8 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  37.23 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2169  spermidine synthase  42.59 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  37.04 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  39.62 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  38.27 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  38.27 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  34.83 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  35.97 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  38.57 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  39.55 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  34.08 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  36.76 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  34.46 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  39.21 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  35.21 
 
 		 279 aa  192  7e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  36.4 
 
 		 275 aa  192  7e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  35.8 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  38.87 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  34.15 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  36.33 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  40.22 
 
 		 275 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  37.74 
 
 		 273 aa  188  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  40.22 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  35.17 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  36.33 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  40.61 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  39.85 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  39.85 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  39.85 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  39.85 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  39.85 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  39.85 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  39.85 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  39.85 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  39.85 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  40.23 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  34.8 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  38.38 
 
 		 275 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  42.42 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  35.4 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  38.6 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2930  spermidine synthase  34.88 
 
 		 275 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  35.87 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  35.54 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  35.89 
 
 		 320 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  33.67 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  34.34 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  32.14 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  31.85 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  35.09 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  34.28 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  34.21 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  35.02 
 
 		 304 aa  168  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  31.93 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  35.13 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  34.41 
 
 		 748 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3769  spermidine synthase  34.86 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>