More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4694 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  100 
 
 		 522 aa  996    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  66.47 
 
 		 520 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  66.67 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  66.67 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  63.49 
 
 		 523 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  51.87 
 
 		 538 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  51.09 
 
 		 533 aa  435  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  52.02 
 
 		 519 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  49.42 
 
 		 528 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  48.62 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  48.64 
 
 		 521 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  38.26 
 
 		 508 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  38.31 
 
 		 498 aa  326  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  39.8 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  39.82 
 
 		 536 aa  319  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  41.77 
 
 		 521 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  40 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  40 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  40 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  40 
 
 		 504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  40 
 
 		 504 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  39.38 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  43.02 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  38.37 
 
 		 503 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  39.69 
 
 		 503 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  39.59 
 
 		 525 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  39.59 
 
 		 525 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  39.02 
 
 		 527 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  40.67 
 
 		 528 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  39.74 
 
 		 525 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  39.58 
 
 		 510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  33.27 
 
 		 510 aa  286  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  39.27 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  38.88 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  38.59 
 
 		 510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  37.64 
 
 		 529 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  37.4 
 
 		 567 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  29.49 
 
 		 568 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  29.83 
 
 		 571 aa  190  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  30.84 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  29.12 
 
 		 570 aa  188  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  28.84 
 
 		 575 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  30.42 
 
 		 595 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  46.26 
 
 		 363 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  30.57 
 
 		 577 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  44.5 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  30.23 
 
 		 577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  28.75 
 
 		 586 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  30.91 
 
 		 574 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  30.91 
 
 		 574 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  30.1 
 
 		 576 aa  179  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  30.91 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  44.65 
 
 		 360 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  44.65 
 
 		 360 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  30.91 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  44.44 
 
 		 360 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  44.39 
 
 		 360 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  44.04 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  44.04 
 
 		 405 aa  176  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  30.37 
 
 		 577 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  29.28 
 
 		 575 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  30.3 
 
 		 574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  31.11 
 
 		 574 aa  174  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  36.97 
 
 		 305 aa  150  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  34.85 
 
 		 312 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  34.8 
 
 		 289 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  34.71 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  31.87 
 
 		 304 aa  133  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  36.76 
 
 		 817 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  34.21 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  35.24 
 
 		 291 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  35.58 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  32.9 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  30.31 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  34.34 
 
 		 292 aa  126  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  39.04 
 
 		 278 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  32.06 
 
 		 314 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  31.54 
 
 		 328 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  35.48 
 
 		 283 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  30.88 
 
 		 310 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  38.1 
 
 		 285 aa  124  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  35.22 
 
 		 303 aa  124  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  36.96 
 
 		 283 aa  124  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  33.96 
 
 		 276 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  29.89 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  29.89 
 
 		 308 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  36.24 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  37.14 
 
 		 285 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  37.14 
 
 		 285 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  37.14 
 
 		 285 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  37.14 
 
 		 285 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  37.14 
 
 		 285 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  37.14 
 
 		 285 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  32.74 
 
 		 277 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  31.89 
 
 		 280 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  31.5 
 
 		 280 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  31.51 
 
 		 275 aa  117  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  32.55 
 
 		 326 aa  117  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  36.36 
 
 		 295 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  38.01 
 
 		 293 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>