256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A5332 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  89.81 
 
 
360 aa  683    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  82.22 
 
 
405 aa  673    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  89.16 
 
 
369 aa  669    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  93.66 
 
 
360 aa  683    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  89.81 
 
 
360 aa  683    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  90.36 
 
 
360 aa  687    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  100 
 
 
363 aa  749    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  86.93 
 
 
375 aa  659    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  46.33 
 
 
528 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  44.3 
 
 
504 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  44.73 
 
 
504 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  44.73 
 
 
504 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  44.73 
 
 
504 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  43.88 
 
 
504 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  45.66 
 
 
536 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  44.3 
 
 
504 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  42.57 
 
 
499 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  42.68 
 
 
498 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  46.26 
 
 
522 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  46.08 
 
 
515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  46.4 
 
 
538 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  42.8 
 
 
528 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  43.81 
 
 
525 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  43.81 
 
 
525 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  46.98 
 
 
533 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  44.29 
 
 
525 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  44.29 
 
 
510 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  43.6 
 
 
503 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  44.09 
 
 
519 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  44.29 
 
 
503 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  45.62 
 
 
521 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  38.18 
 
 
514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  39.43 
 
 
510 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  43.72 
 
 
527 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  40.43 
 
 
521 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  39.43 
 
 
521 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  40.65 
 
 
508 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  42.99 
 
 
567 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  40.16 
 
 
520 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  40.16 
 
 
520 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  40.56 
 
 
520 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  45.1 
 
 
510 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  36.61 
 
 
568 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  38.13 
 
 
529 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  39.92 
 
 
523 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  36.6 
 
 
571 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  36.78 
 
 
570 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  37.22 
 
 
326 aa  139  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  36.77 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  36.61 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  36.87 
 
 
310 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  33.03 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  37.44 
 
 
303 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  39.57 
 
 
520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  36.36 
 
 
817 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  38.97 
 
 
301 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  34.31 
 
 
291 aa  126  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  37.04 
 
 
289 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  35.04 
 
 
307 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  35.48 
 
 
308 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  41.18 
 
 
574 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  36.23 
 
 
566 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  38.75 
 
 
576 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  38.91 
 
 
575 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  39.82 
 
 
574 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  41.35 
 
 
577 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  41.35 
 
 
577 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  39.82 
 
 
574 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  41.35 
 
 
577 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  39.82 
 
 
574 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  39.82 
 
 
574 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  32.57 
 
 
276 aa  119  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  34.62 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  35.96 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  35.19 
 
 
575 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  34.48 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  34.42 
 
 
304 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  39.17 
 
 
595 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  36.78 
 
 
586 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  39.42 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  41.14 
 
 
279 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  35.1 
 
 
291 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  33.04 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  32.59 
 
 
375 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  31.67 
 
 
308 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  31.67 
 
 
308 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  31.11 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  33.75 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  32.31 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  31.8 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  30.93 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  32.59 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  32.57 
 
 
280 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  30.28 
 
 
283 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  32.71 
 
 
281 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  31.34 
 
 
280 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  32.74 
 
 
277 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  28.9 
 
 
283 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  29.25 
 
 
285 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  31.19 
 
 
279 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>