254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A5377 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  100 
 
 
375 aa  774    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  87.73 
 
 
360 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  84.2 
 
 
405 aa  688    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  90.13 
 
 
369 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  88.53 
 
 
363 aa  685    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  87.73 
 
 
360 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  87.2 
 
 
360 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  88 
 
 
360 aa  679    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  46.98 
 
 
528 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  46.85 
 
 
538 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  44.12 
 
 
504 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  44.54 
 
 
504 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  44.54 
 
 
504 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  44.54 
 
 
504 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  43.7 
 
 
504 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  44.12 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  46.05 
 
 
499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  45.21 
 
 
536 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  47.91 
 
 
533 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  43.15 
 
 
498 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  44.5 
 
 
522 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  45.41 
 
 
525 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  45.41 
 
 
525 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  45.92 
 
 
525 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  45.92 
 
 
510 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  40.68 
 
 
528 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  42.45 
 
 
503 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  44.65 
 
 
515 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  43.18 
 
 
519 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  40.86 
 
 
521 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  43.75 
 
 
503 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  38.79 
 
 
510 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  43.12 
 
 
527 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  39.37 
 
 
514 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  38.79 
 
 
521 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  44.24 
 
 
521 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  42.34 
 
 
567 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  42.56 
 
 
508 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  45.69 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  38.96 
 
 
520 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  38.96 
 
 
520 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  39.36 
 
 
520 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  37.25 
 
 
529 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  37.5 
 
 
523 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  36.73 
 
 
568 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  36.23 
 
 
571 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  37.45 
 
 
305 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  38 
 
 
570 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  36.82 
 
 
326 aa  133  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  36.36 
 
 
310 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  36.49 
 
 
817 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  36.82 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  40.09 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  34.45 
 
 
291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  36.41 
 
 
303 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.158612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  38.03 
 
 
301 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  32.57 
 
 
304 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  34.39 
 
 
308 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  35.4 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  33.33 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  36.79 
 
 
289 aa  119  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  38.32 
 
 
576 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  32.57 
 
 
276 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  31.97 
 
 
308 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  31.97 
 
 
308 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  38.33 
 
 
574 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  33.75 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  39.9 
 
 
574 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  39.9 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  39.9 
 
 
574 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  39.9 
 
 
577 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  39.9 
 
 
577 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  39.9 
 
 
577 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  33.64 
 
 
291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  38.08 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  33.33 
 
 
312 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  35.07 
 
 
566 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  39.9 
 
 
574 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  34.44 
 
 
575 aa  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  34.63 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  38.68 
 
 
595 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  35.18 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  31.2 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  33.04 
 
 
349 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  36.25 
 
 
586 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  32.59 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  38.46 
 
 
574 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  31.19 
 
 
279 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  32.09 
 
 
283 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  33.33 
 
 
289 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  30.73 
 
 
283 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  31.92 
 
 
280 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  39.43 
 
 
279 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  34.86 
 
 
286 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  31.46 
 
 
280 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  32.11 
 
 
281 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  33.17 
 
 
283 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  31.67 
 
 
277 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  30.99 
 
 
280 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  29.72 
 
 
285 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>