243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2857 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2857  spermidine synthase  100 
 
 		 817 aa  1667    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00246642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  36.76 
 
 		 522 aa  144  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  36.94 
 
 		 405 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  36.49 
 
 		 375 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  36.94 
 
 		 360 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  36.94 
 
 		 369 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  36.49 
 
 		 360 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  38.52 
 
 		 504 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  37.74 
 
 		 504 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  38.52 
 
 		 504 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  36.36 
 
 		 363 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  38.52 
 
 		 504 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  36.82 
 
 		 360 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  36.82 
 
 		 360 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  36.43 
 
 		 520 aa  138  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  36.05 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  36.05 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  37.35 
 
 		 504 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  38.68 
 
 		 523 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  37.74 
 
 		 504 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  34.81 
 
 		 528 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  36.15 
 
 		 525 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  36.15 
 
 		 525 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  33.33 
 
 		 525 aa  131  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  33.33 
 
 		 510 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  34.69 
 
 		 503 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  38.6 
 
 		 536 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  34.58 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  35.02 
 
 		 538 aa  125  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  32.72 
 
 		 503 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  32.95 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  30.16 
 
 		 508 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  33.33 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  35.16 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  33.33 
 
 		 521 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  30.51 
 
 		 499 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  34.67 
 
 		 529 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  31.88 
 
 		 521 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  32 
 
 		 527 aa  115  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  33.33 
 
 		 515 aa  115  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  33.65 
 
 		 533 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  31.8 
 
 		 498 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  34.98 
 
 		 510 aa  111  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  32.69 
 
 		 528 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  33.21 
 
 		 307 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  29.51 
 
 		 571 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  33.18 
 
 		 567 aa  108  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  30.19 
 
 		 308 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  30.19 
 
 		 308 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  31.17 
 
 		 289 aa  101  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  29.68 
 
 		 291 aa  101  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  27.3 
 
 		 568 aa  100  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  28.02 
 
 		 303 aa  99.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  29.55 
 
 		 326 aa  99  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  29.87 
 
 		 291 aa  98.6  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  26.98 
 
 		 310 aa  98.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  27.06 
 
 		 304 aa  98.2  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  28 
 
 		 304 aa  98.2  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  30.52 
 
 		 285 aa  97.8  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  33.01 
 
 		 301 aa  96.3  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  29.96 
 
 		 286 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  28.71 
 
 		 291 aa  95.9  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  29.7 
 
 		 305 aa  96.3  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  37.82 
 
 		 290 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  36.57 
 
 		 285 aa  95.5  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  36.57 
 
 		 285 aa  95.5  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  36.57 
 
 		 285 aa  95.5  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  36.57 
 
 		 285 aa  95.5  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  36.57 
 
 		 285 aa  95.5  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  36.57 
 
 		 285 aa  95.5  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  31.28 
 
 		 285 aa  95.1  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  37.58 
 
 		 285 aa  94.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  28.04 
 
 		 570 aa  94  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  31.03 
 
 		 283 aa  92.8  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  29.69 
 
 		 286 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  28.57 
 
 		 289 aa  92.4  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  37.18 
 
 		 293 aa  92.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  32.02 
 
 		 295 aa  92.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  31.78 
 
 		 279 aa  92  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  32.67 
 
 		 285 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  27.06 
 
 		 313 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  28.7 
 
 		 286 aa  91.3  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  32.18 
 
 		 285 aa  91.3  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  31.14 
 
 		 285 aa  90.9  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  29.25 
 
 		 291 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  29.96 
 
 		 286 aa  90.5  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  27.55 
 
 		 277 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  29.5 
 
 		 586 aa  89.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  33.18 
 
 		 520 aa  89.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  29.31 
 
 		 577 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  31.03 
 
 		 273 aa  88.6  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  29.31 
 
 		 574 aa  88.2  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  29.31 
 
 		 577 aa  87.8  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  29.31 
 
 		 577 aa  87.8  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  31.19 
 
 		 285 aa  87.8  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  31.19 
 
 		 285 aa  87.8  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  27.53 
 
 		 595 aa  87.8  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  31.19 
 
 		 285 aa  87.8  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  33.33 
 
 		 283 aa  87.4  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  28.92 
 
 		 287 aa  87  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>