More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1858 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  100 
 
 		 314 aa  648    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  79.68 
 
 		 312 aa  533  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  44.75 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  44.07 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  45.07 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  39.66 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  39.67 
 
 		 303 aa  222  8e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  40 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  40.67 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  42.09 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  38.61 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  37.97 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  37.97 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  38.38 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  34.92 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  41.86 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  40.6 
 
 		 301 aa  199  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  42.68 
 
 		 289 aa  198  9e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  39.92 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  40.24 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  37.5 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  37.78 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  37.5 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  37.5 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  37.5 
 
 		 286 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  37.13 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  37.13 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  37.13 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  37.13 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  37.13 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  37.13 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  37.13 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  37.13 
 
 		 288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  36.76 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  34.04 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  34.51 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  37.31 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  35.99 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  36.7 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  35.99 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  35.96 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  35.96 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  35.96 
 
 		 296 aa  175  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  34.67 
 
 		 291 aa  175  9e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  36.04 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  35.82 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  35.96 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  34.83 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  35.32 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  36.75 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  35.84 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  36.49 
 
 		 277 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  35.31 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1964  spermidine synthase  35.87 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.569543  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  34.07 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  34.97 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  34.97 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  33.7 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  34.74 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  32.96 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  33.21 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  34.07 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  36.54 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  32.28 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  34.56 
 
 		 292 aa  158  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  33.7 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0744  spermidine synthase  36.14 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  35.06 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  35.36 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  33.71 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  33.46 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  33.59 
 
 		 279 aa  155  9e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  31.85 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  31.85 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2319  Spermine synthase  32.26 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.961165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  31.85 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  31.85 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  31.85 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  31.85 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  32.69 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  31.99 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  31.87 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  33.46 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  33.46 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  33.45 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  36.84 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  32.55 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  32.55 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  32.55 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  31.85 
 
 		 285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  34.39 
 
 		 281 aa  153  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  35.07 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  33.72 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  34.04 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0886  spermidine synthase  36.92 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  31.44 
 
 		 283 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  32.17 
 
 		 277 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  31.44 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  32.75 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  33.7 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>