296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2319 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2319  Spermine synthase  100 
 
 		 309 aa  635    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.961165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  47.84 
 
 		 308 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  47.84 
 
 		 308 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  45.6 
 
 		 313 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  45 
 
 		 310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  43.48 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  38.78 
 
 		 326 aa  221  9e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  35.74 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  33.11 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  33.11 
 
 		 304 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  31.53 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  41.59 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  34.27 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  35.76 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  32.9 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  37.18 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  35.42 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  32.26 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  31.77 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  36.36 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  27.05 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  34.74 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  35.32 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  35.08 
 
 		 275 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  34.71 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  33.21 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  34.06 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  33.69 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  34.55 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  33.7 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  33.81 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  40.16 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  33.33 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  33.09 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  32.06 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  31.6 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  32.34 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  32 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  32 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  32 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  34.15 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  32.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  32.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  40.57 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  32.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  33.33 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  32.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  32.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  32.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  32.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  32.71 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  31.48 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  31.65 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  31.27 
 
 		 375 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  32.71 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  32.74 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  33.08 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  33.08 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  33.08 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  33.08 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  31.27 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  33.08 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  33.08 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  38.6 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  32.48 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  31.49 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  32.34 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  32.34 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  32.34 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  33.08 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  32.63 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  31.03 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  34.74 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  33.46 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  32.31 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  31.7 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  32.39 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  31.85 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  32.92 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  32 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  31.72 
 
 		 280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  34.39 
 
 		 275 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  33.22 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  34.39 
 
 		 275 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  34.39 
 
 		 275 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  34.39 
 
 		 275 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  34.39 
 
 		 275 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  34.39 
 
 		 275 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  34.39 
 
 		 275 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  33.57 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  34.39 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  40.17 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  37.08 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  31.97 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  37.96 
 
 		 275 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  34.04 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  28.89 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  31.95 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  31.23 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1389  spermidine synthase  38.1 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>