More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0744 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0744  spermidine synthase  100 
 
 		 431 aa  869    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  54.44 
 
 		 285 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  55.19 
 
 		 285 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  54.44 
 
 		 285 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  54.44 
 
 		 285 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  54.44 
 
 		 285 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  54.81 
 
 		 285 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  54.44 
 
 		 295 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  53.7 
 
 		 285 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  53.7 
 
 		 285 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  53.7 
 
 		 285 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  53.7 
 
 		 285 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  53.7 
 
 		 285 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  53.7 
 
 		 285 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  53.7 
 
 		 285 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  53.33 
 
 		 285 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  55.34 
 
 		 296 aa  279  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  51.87 
 
 		 293 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  45.77 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  49.45 
 
 		 290 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  51.84 
 
 		 320 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  51.47 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2981  spermidine synthase  46.18 
 
 		 324 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  36.69 
 
 		 277 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  39.08 
 
 		 277 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  34.91 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  34.27 
 
 		 304 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  36.29 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  41.27 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  40.48 
 
 		 286 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  38.35 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  36.05 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  40.48 
 
 		 286 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  30.96 
 
 		 276 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  35.11 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  40.39 
 
 		 286 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  34.24 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  39.23 
 
 		 286 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  36.61 
 
 		 289 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  35.21 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  34.04 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  35.38 
 
 		 275 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  34.04 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  38.89 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  36.64 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  36.14 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  31.56 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  35.13 
 
 		 296 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  35.13 
 
 		 296 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  35.13 
 
 		 296 aa  170  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  35.57 
 
 		 289 aa  169  8e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  34.63 
 
 		 277 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  35.29 
 
 		 291 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  34.4 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  36.3 
 
 		 287 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  35.16 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  33.72 
 
 		 288 aa  167  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  32.94 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  33.09 
 
 		 302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  34.44 
 
 		 287 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  33.59 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  33.2 
 
 		 280 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  35.11 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  34.77 
 
 		 288 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  34.41 
 
 		 288 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  34.41 
 
 		 288 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  34.41 
 
 		 288 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  34.41 
 
 		 288 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  34.41 
 
 		 288 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  34.41 
 
 		 288 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  32.82 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  34.41 
 
 		 288 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  32.62 
 
 		 281 aa  163  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  32.81 
 
 		 280 aa  163  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  39.7 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  40 
 
 		 283 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  36.69 
 
 		 271 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1389  spermidine synthase  37.63 
 
 		 284 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  35 
 
 		 288 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  35.97 
 
 		 291 aa  162  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  35.99 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  32.14 
 
 		 278 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  32.98 
 
 		 278 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  32.98 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  33.81 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  34.25 
 
 		 293 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  34.43 
 
 		 286 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  34.43 
 
 		 286 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  34.43 
 
 		 286 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  32.74 
 
 		 279 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  29.12 
 
 		 286 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  34.43 
 
 		 286 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  34.43 
 
 		 286 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  32.62 
 
 		 273 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  34.35 
 
 		 295 aa  157  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  33.33 
 
 		 275 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  33.86 
 
 		 296 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  35.87 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2169  spermidine synthase  37.58 
 
 		 296 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  37.11 
 
 		 292 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>