272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3170 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  100 
 
 		 529 aa  1063    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  47.65 
 
 		 536 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  41.19 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  41.37 
 
 		 499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  38.58 
 
 		 508 aa  356  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  38.72 
 
 		 567 aa  346  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  40.85 
 
 		 527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  40.08 
 
 		 521 aa  334  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  41.28 
 
 		 510 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  41.33 
 
 		 521 aa  332  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  41.27 
 
 		 528 aa  329  9e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  38.46 
 
 		 503 aa  326  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  37.52 
 
 		 503 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  39.2 
 
 		 514 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  37.25 
 
 		 510 aa  319  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  39.03 
 
 		 504 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  38.99 
 
 		 510 aa  316  8e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  38.6 
 
 		 525 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  38.6 
 
 		 525 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  38.99 
 
 		 525 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  38.83 
 
 		 504 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  38.83 
 
 		 504 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  39.03 
 
 		 504 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  38.83 
 
 		 504 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  38.83 
 
 		 504 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  36.55 
 
 		 515 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  36.78 
 
 		 528 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  39.69 
 
 		 521 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  37.5 
 
 		 533 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  40.42 
 
 		 519 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  37.41 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  36.28 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  39.08 
 
 		 520 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  39.08 
 
 		 520 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  38.97 
 
 		 520 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  37.38 
 
 		 522 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  38.29 
 
 		 523 aa  267  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  30.16 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  30.16 
 
 		 570 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  28.4 
 
 		 566 aa  169  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  28.24 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  28.96 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  37.25 
 
 		 375 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  28.64 
 
 		 575 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  38.13 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  37.74 
 
 		 360 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  28.47 
 
 		 575 aa  156  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  39.46 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  39.46 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  37.35 
 
 		 360 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  37.35 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  27.19 
 
 		 595 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  37.35 
 
 		 405 aa  150  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  27.5 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  27.98 
 
 		 577 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  28.88 
 
 		 574 aa  146  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  28.03 
 
 		 577 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  28.66 
 
 		 576 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  27.98 
 
 		 577 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  34.64 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  34.27 
 
 		 326 aa  143  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  27.52 
 
 		 574 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  27.52 
 
 		 574 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  27.63 
 
 		 529 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  27.27 
 
 		 574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  31.54 
 
 		 275 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  27.09 
 
 		 574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  35.11 
 
 		 301 aa  131  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  29.35 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  31.95 
 
 		 286 aa  124  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  31.52 
 
 		 286 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  33.91 
 
 		 303 aa  123  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  32.31 
 
 		 283 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  28.99 
 
 		 286 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  36.07 
 
 		 286 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  33.61 
 
 		 308 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  33.61 
 
 		 308 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  30.38 
 
 		 286 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  29.8 
 
 		 283 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  37.13 
 
 		 328 aa  118  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  30.34 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  30.34 
 
 		 288 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  30.34 
 
 		 288 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  30.34 
 
 		 288 aa  117  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  30.34 
 
 		 288 aa  117  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  30.34 
 
 		 288 aa  117  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  30.34 
 
 		 288 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  30.34 
 
 		 288 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  30.34 
 
 		 288 aa  117  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  33.49 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  31.56 
 
 		 310 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  30.47 
 
 		 283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  29.62 
 
 		 277 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  27.86 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  27.86 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  30.96 
 
 		 288 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  31.2 
 
 		 283 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  30.21 
 
 		 286 aa  114  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  30.13 
 
 		 291 aa  114  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  32.35 
 
 		 304 aa  114  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>