178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2430 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  100 
 
 		 529 aa  1067    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  29.45 
 
 		 510 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  26.31 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  27.77 
 
 		 515 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  28.48 
 
 		 528 aa  143  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  28.21 
 
 		 528 aa  143  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  27.66 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  28.89 
 
 		 536 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  27.73 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  25.74 
 
 		 498 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  29.74 
 
 		 567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  25.28 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  28.07 
 
 		 529 aa  130  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  27.43 
 
 		 525 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  27.43 
 
 		 525 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  27.86 
 
 		 525 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  27.43 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  28.85 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  27.79 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  27.27 
 
 		 504 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  27.08 
 
 		 504 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  27.08 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  27.94 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  27.94 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  27.94 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  27.15 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  25.8 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  25.94 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  26.5 
 
 		 520 aa  110  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  28.27 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  27.11 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  24.84 
 
 		 514 aa  104  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  24.12 
 
 		 568 aa  96.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  26.25 
 
 		 538 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  26.23 
 
 		 520 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  26.23 
 
 		 520 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2666  spermidine synthase  25.98 
 
 		 571 aa  91.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00544767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  32.4 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3480  spermidine synthase  24.74 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.212317  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  25.11 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  24 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  25.28 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  29.29 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  29.29 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  29.29 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  29.29 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  28.79 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  26.25 
 
 		 363 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3264  spermidine synthase  23.14 
 
 		 586 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  29.29 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0699  spermidine synthase  24.06 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000065174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  29.38 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  20.62 
 
 		 749 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0625  spermidine synthase  22.96 
 
 		 575 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.415321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0829  spermidine synthase  23.6 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0724  spermidine synthase  24.48 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105401  hitchhiker  0.00000291342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3763  spermidine synthase  23.75 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3089  spermidine synthase  24.54 
 
 		 574 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170369  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0890  spermidine synthase  23.43 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.164164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3112  spermidine synthase  23.6 
 
 		 577 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0924  spermidine synthase  24.58 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0914  spermidine synthase  24.58 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.013206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3836  spermidine synthase  23.33 
 
 		 595 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0396024  unclonable  0.000000000324026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0860  spermidine synthase  23.41 
 
 		 577 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  28.49 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  20.89 
 
 		 982 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  23.61 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  22.27 
 
 		 837 aa  67  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  28.14 
 
 		 283 aa  67  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  29.68 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  27.41 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  23.71 
 
 		 844 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  30.68 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  26.67 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  20.49 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  26.83 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  28.85 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  29.05 
 
 		 692 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  19.96 
 
 		 983 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  23.25 
 
 		 782 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.55 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  24.62 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  26.67 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3448  spermidine synthase  24.21 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193946  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  31.49 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  24.62 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  28.88 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  31.88 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  26.32 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  26.97 
 
 		 287 aa  57  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  28.5 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  26.29 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  27.32 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  27.81 
 
 		 313 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.23 
 
 		 516 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  28.34 
 
 		 303 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  25.71 
 
 		 286 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  23.93 
 
 		 876 aa  54.3  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  27.68 
 
 		 280 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  27.46 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>