255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3160 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  44.62 
 
 		 1017 aa  698    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  90.03 
 
 		 983 aa  1683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  100 
 
 		 982 aa  1923    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  57.38 
 
 		 991 aa  1027    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  38.34 
 
 		 1078 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  38.42 
 
 		 1078 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1079 aa  360  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  32.98 
 
 		 835 aa  348  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  33.5 
 
 		 876 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  32.82 
 
 		 836 aa  302  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  30.31 
 
 		 749 aa  293  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  33.07 
 
 		 842 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  31.19 
 
 		 844 aa  278  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  28.96 
 
 		 782 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  29.76 
 
 		 803 aa  250  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  31.69 
 
 		 830 aa  243  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  29.37 
 
 		 837 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  29.85 
 
 		 819 aa  220  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  29.31 
 
 		 903 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  28.84 
 
 		 758 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  29.55 
 
 		 759 aa  147  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  26.23 
 
 		 765 aa  132  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  30.95 
 
 		 875 aa  130  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  27.64 
 
 		 765 aa  127  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  32 
 
 		 1040 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  30.8 
 
 		 304 aa  102  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  33.58 
 
 		 302 aa  92  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  30 
 
 		 277 aa  91.7  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  29.49 
 
 		 295 aa  91.7  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  26.09 
 
 		 287 aa  91.7  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  33.74 
 
 		 312 aa  89.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  31.01 
 
 		 296 aa  90.1  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  30.38 
 
 		 293 aa  89  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  27.27 
 
 		 326 aa  87.4  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  36.33 
 
 		 753 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  30.92 
 
 		 287 aa  86.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  30.92 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  30.05 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  31.17 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  31.33 
 
 		 286 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  31.33 
 
 		 286 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  31.33 
 
 		 286 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  31.33 
 
 		 286 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  31.33 
 
 		 286 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  32.93 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  32.93 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  32.93 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  32.93 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  31.52 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  32.93 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  32.93 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  32.93 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  32.93 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  28.57 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  28.5 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  28.5 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  28.5 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  30.32 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  30.93 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  32.34 
 
 		 288 aa  80.9  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  30.89 
 
 		 288 aa  80.1  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  31.06 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  33.1 
 
 		 286 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  30.39 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  29.67 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  24 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  33.33 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  29.12 
 
 		 275 aa  77  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  29.41 
 
 		 283 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  29.41 
 
 		 283 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  32.69 
 
 		 310 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  29.84 
 
 		 275 aa  77.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  29.75 
 
 		 748 aa  76.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  24.56 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  33.11 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  28.57 
 
 		 304 aa  76.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  28.9 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  29.63 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  29.19 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  26.16 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  32.43 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  30.09 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  26.5 
 
 		 528 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  33.77 
 
 		 285 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  34.15 
 
 		 286 aa  73.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  33.12 
 
 		 295 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  31.1 
 
 		 277 aa  73.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  28.64 
 
 		 291 aa  73.6  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  21.69 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  33.07 
 
 		 328 aa  72  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  30.19 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  26.21 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  26.22 
 
 		 538 aa  71.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  32.47 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  32.47 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  32.43 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  28.11 
 
 		 289 aa  71.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  32.47 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  32.47 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  32.47 
 
 		 285 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>