223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0583 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  100 
 
 		 837 aa  1696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  30.15 
 
 		 983 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  30.1 
 
 		 749 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  30.34 
 
 		 991 aa  234  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  30.11 
 
 		 1017 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  28.7 
 
 		 982 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  29.45 
 
 		 876 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  28.13 
 
 		 844 aa  208  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  28.74 
 
 		 836 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  29.18 
 
 		 1078 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  29.46 
 
 		 1078 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1079 aa  193  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  28.81 
 
 		 842 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  30.86 
 
 		 835 aa  174  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  26.2 
 
 		 803 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  26.23 
 
 		 782 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  26.99 
 
 		 830 aa  161  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  27.63 
 
 		 1040 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  25.88 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  25.63 
 
 		 758 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  26.01 
 
 		 875 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  27.69 
 
 		 765 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  28.03 
 
 		 765 aa  105  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  27.74 
 
 		 759 aa  95.9  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  31.32 
 
 		 903 aa  91.3  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  26.91 
 
 		 753 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  25 
 
 		 536 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  33.13 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  23.77 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  25.85 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  25.85 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  29.79 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  23.16 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  28.86 
 
 		 312 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  23.13 
 
 		 510 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  22.62 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  28.73 
 
 		 314 aa  72  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  24.56 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  24.94 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  27.84 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  24.1 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  30.43 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  24.4 
 
 		 503 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  27.23 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  26.9 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  26.9 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  28.24 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  27.51 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  24.76 
 
 		 510 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  26.61 
 
 		 296 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  26.61 
 
 		 296 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  26.61 
 
 		 296 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  24.55 
 
 		 515 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  26.94 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2880  spermidine synthase  24.58 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.548533 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  27.54 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  27.54 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  26.07 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  27.54 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  27.54 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  27.54 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  23.61 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  26.48 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  27.54 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  27.54 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  27.54 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  26.94 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  26.13 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  28.12 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  25.13 
 
 		 283 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  28.25 
 
 		 286 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  24.3 
 
 		 529 aa  63.9  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  27.04 
 
 		 286 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  28.14 
 
 		 289 aa  64.3  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  28.42 
 
 		 290 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  21.45 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  24.71 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  26.95 
 
 		 288 aa  63.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  26.95 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  26.95 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  26.95 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  26.95 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  28.1 
 
 		 757 aa  62.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  26.95 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  34.97 
 
 		 307 aa  62.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  24.51 
 
 		 538 aa  62.4  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  23.03 
 
 		 521 aa  62  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  21.8 
 
 		 504 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  28.3 
 
 		 289 aa  60.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  22.27 
 
 		 521 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  23.94 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  22.04 
 
 		 510 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  21.82 
 
 		 504 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  21.82 
 
 		 504 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2169  spermidine synthase  28.02 
 
 		 296 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  21.82 
 
 		 504 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  28.14 
 
 		 303 aa  59.7  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  30.2 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  25.33 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  25.83 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>