237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0266 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  46.02 
 
 		 835 aa  685    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  100 
 
 		 749 aa  1510    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  52.16 
 
 		 836 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  29.28 
 
 		 1017 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  30.47 
 
 		 983 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  31.73 
 
 		 1078 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  31.58 
 
 		 1078 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  30.2 
 
 		 991 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1079 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  29.9 
 
 		 982 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  28.82 
 
 		 876 aa  267  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  28.82 
 
 		 844 aa  257  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  28.4 
 
 		 842 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  30.1 
 
 		 837 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  27.15 
 
 		 782 aa  234  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  27.99 
 
 		 830 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  28.59 
 
 		 1040 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  25.31 
 
 		 803 aa  200  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  25.73 
 
 		 819 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  26.64 
 
 		 903 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  26.41 
 
 		 875 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  26.93 
 
 		 758 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.09 
 
 		 516 aa  95.5  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  24.71 
 
 		 558 aa  90.9  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  23.36 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  22.87 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  23.9 
 
 		 765 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  24.71 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  25.57 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  24.68 
 
 		 759 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  22.86 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  27.93 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  24.04 
 
 		 765 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  30.37 
 
 		 279 aa  72  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  28.64 
 
 		 287 aa  72  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  24.58 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  20.09 
 
 		 529 aa  71.6  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  30 
 
 		 302 aa  70.5  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  33.61 
 
 		 283 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  33.61 
 
 		 283 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  33.09 
 
 		 287 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  34.56 
 
 		 289 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  23.29 
 
 		 528 aa  70.1  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  31.18 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  31.18 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  28.91 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  29.38 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  24.7 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  32.05 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  23.37 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  32.35 
 
 		 286 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  28.8 
 
 		 286 aa  67  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  23.39 
 
 		 551 aa  67.4  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  32.35 
 
 		 286 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  32.35 
 
 		 286 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  25.95 
 
 		 296 aa  67  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  32.35 
 
 		 286 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  32.35 
 
 		 286 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  27.45 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  27.41 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  35.2 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  27.41 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  25.95 
 
 		 293 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  30.85 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  25.78 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  27.85 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  34.17 
 
 		 520 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  34.17 
 
 		 520 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  33.33 
 
 		 520 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  32.35 
 
 		 287 aa  63.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  28.15 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  23.46 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  26.62 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  31.4 
 
 		 284 aa  62  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  29.21 
 
 		 320 aa  62  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  28 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  28.71 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  28.46 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  28.1 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  21.81 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  30.4 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.7 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  32.79 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  31.97 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  24.78 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  27.2 
 
 		 286 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  25.83 
 
 		 291 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  25.6 
 
 		 286 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  25.6 
 
 		 286 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  30.15 
 
 		 287 aa  60.1  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  30.4 
 
 		 280 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  26.61 
 
 		 283 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>