185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0540 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  100 
 
 		 782 aa  1579    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  28.86 
 
 		 983 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  28.39 
 
 		 991 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  29.01 
 
 		 982 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  30.2 
 
 		 876 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  28.54 
 
 		 1017 aa  247  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  31.6 
 
 		 1078 aa  244  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  31.8 
 
 		 1078 aa  240  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1079 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  27.24 
 
 		 749 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  29.22 
 
 		 844 aa  235  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  27.7 
 
 		 842 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  29.59 
 
 		 830 aa  210  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  26.52 
 
 		 836 aa  206  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  30.44 
 
 		 875 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  25.51 
 
 		 837 aa  172  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  27.46 
 
 		 803 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  24.93 
 
 		 1040 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  27.09 
 
 		 819 aa  161  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  28.54 
 
 		 903 aa  161  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  26.27 
 
 		 835 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  26.12 
 
 		 758 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  26.37 
 
 		 765 aa  127  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  28.12 
 
 		 759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  24.59 
 
 		 765 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  27.06 
 
 		 753 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  34.62 
 
 		 283 aa  87  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.49 
 
 		 558 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  29.82 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  23.45 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  30.41 
 
 		 291 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  22.84 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  23.68 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  25.06 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  23.85 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  28.57 
 
 		 757 aa  72  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  32.81 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  32.81 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  34.4 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  23.57 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  25.66 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  25 
 
 		 805 aa  67.4  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  34.92 
 
 		 286 aa  67  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  25.96 
 
 		 520 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  26.99 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  26.99 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  22.3 
 
 		 533 aa  65.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  27.82 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  25 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  26.76 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  26.17 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  23.23 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  21.79 
 
 		 508 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  24.2 
 
 		 302 aa  63.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  23.38 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  23.38 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  26.01 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  23.71 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  21.12 
 
 		 498 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  27.03 
 
 		 304 aa  60.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  25.87 
 
 		 279 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  24.17 
 
 		 551 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  27.43 
 
 		 974 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  29.37 
 
 		 287 aa  59.7  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  24.69 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  26.24 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  22.35 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1389  spermidine synthase  27.17 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  25 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  24.54 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  24.03 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  29.53 
 
 		 203 aa  57  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  25.31 
 
 		 305 aa  57  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  26.85 
 
 		 279 aa  56.2  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  25.5 
 
 		 277 aa  56.2  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  28.92 
 
 		 289 aa  56.6  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  27.5 
 
 		 314 aa  55.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  28.08 
 
 		 349 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  23.38 
 
 		 277 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  28.12 
 
 		 275 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  25.44 
 
 		 521 aa  55.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  24.34 
 
 		 548 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  30.45 
 
 		 492 aa  55.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  24.25 
 
 		 607 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  28.57 
 
 		 287 aa  55.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  24.67 
 
 		 276 aa  55.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  25.48 
 
 		 278 aa  55.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  25.2 
 
 		 288 aa  54.7  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  28.08 
 
 		 375 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  24.5 
 
 		 277 aa  53.5  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  26.62 
 
 		 275 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  26.8 
 
 		 271 aa  53.9  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  27.27 
 
 		 296 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  27.27 
 
 		 296 aa  53.9  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  24.65 
 
 		 286 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  27.27 
 
 		 296 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  25.15 
 
 		 313 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  30.89 
 
 		 304 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  22.27 
 
 		 490 aa  52.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2880  spermidine synthase  20.91 
 
 		 494 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.548533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>