195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2892 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  100 
 
 		 876 aa  1707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  63.18 
 
 		 842 aa  905    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  65.1 
 
 		 830 aa  941    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  68.7 
 
 		 844 aa  1045    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  32.85 
 
 		 1017 aa  330  9e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  32.77 
 
 		 983 aa  326  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  32.61 
 
 		 982 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  31.03 
 
 		 991 aa  299  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  35.26 
 
 		 1078 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  35.13 
 
 		 1078 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1079 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  31.53 
 
 		 835 aa  269  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  28.76 
 
 		 749 aa  257  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  29.94 
 
 		 782 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  32.21 
 
 		 875 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  33.11 
 
 		 903 aa  215  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  29.87 
 
 		 837 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  27.48 
 
 		 803 aa  201  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  32.52 
 
 		 836 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  25.83 
 
 		 819 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  26.46 
 
 		 758 aa  165  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  27.75 
 
 		 765 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  27.76 
 
 		 759 aa  135  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  27.76 
 
 		 765 aa  129  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  31.86 
 
 		 1040 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  25.3 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  23.22 
 
 		 498 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  25.12 
 
 		 503 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  27.53 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  27.11 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  25.54 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  24.94 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  24.94 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  24.94 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  27.04 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  24.94 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  26.18 
 
 		 521 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  24.94 
 
 		 504 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  24.8 
 
 		 551 aa  70.1  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  33.33 
 
 		 326 aa  69.7  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  35.09 
 
 		 753 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  22.08 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  25.61 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  21.05 
 
 		 558 aa  67  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  24.77 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  24.12 
 
 		 277 aa  66.6  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  27.56 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  24.62 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  23.91 
 
 		 499 aa  64.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  26.67 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  30.14 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  31.28 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  32.72 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  31.28 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  32.72 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  24.71 
 
 		 510 aa  62  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  23.5 
 
 		 516 aa  62  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  31.9 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  24.83 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  24.83 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  31.9 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  23.58 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  21.57 
 
 		 533 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  27.51 
 
 		 528 aa  60.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  30.43 
 
 		 514 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  25.61 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  29.05 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  28.67 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  24.38 
 
 		 805 aa  58.9  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  26.75 
 
 		 974 aa  58.9  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  23.62 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  25.77 
 
 		 291 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  32.12 
 
 		 287 aa  57.4  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  28.49 
 
 		 375 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  28.31 
 
 		 220 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  31.69 
 
 		 524 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  31.1 
 
 		 203 aa  57  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  29 
 
 		 287 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  24.22 
 
 		 502 aa  55.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  24.31 
 
 		 536 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  26.39 
 
 		 286 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  25.49 
 
 		 275 aa  54.3  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  29.41 
 
 		 301 aa  53.5  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  28.26 
 
 		 286 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  33.53 
 
 		 510 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  26.6 
 
 		 490 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  22.98 
 
 		 288 aa  53.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  25.25 
 
 		 538 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.32 
 
 		 307 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  28.26 
 
 		 286 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  27.54 
 
 		 286 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2880  spermidine synthase  25.13 
 
 		 494 aa  52.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.548533 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  25.73 
 
 		 290 aa  52.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  31.09 
 
 		 607 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  23.27 
 
 		 275 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  30.43 
 
 		 249 aa  52  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  23.98 
 
 		 517 aa  52  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  27.78 
 
 		 277 aa  52  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  25.77 
 
 		 302 aa  51.6  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  27.39 
 
 		 299 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>