189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3618 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  100 
 
 		 835 aa  1666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  45.78 
 
 		 749 aa  667    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  79.16 
 
 		 836 aa  1205    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  32.09 
 
 		 983 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  31.35 
 
 		 1017 aa  334  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  32.74 
 
 		 991 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  31.87 
 
 		 844 aa  287  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  32.24 
 
 		 876 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  33.03 
 
 		 982 aa  250  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  30.6 
 
 		 830 aa  241  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1079 aa  222  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.11 
 
 		 1078 aa  222  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  34.11 
 
 		 1078 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  26.6 
 
 		 782 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  28.97 
 
 		 837 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  34 
 
 		 842 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  26.5 
 
 		 803 aa  194  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  27.28 
 
 		 903 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  27.44 
 
 		 819 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1296  putative spermine/spermidine synthase family protein  26.65 
 
 		 875 aa  152  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  26.81 
 
 		 1040 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  24.84 
 
 		 758 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  25.27 
 
 		 759 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  24.38 
 
 		 765 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  25.24 
 
 		 765 aa  87.8  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  24.17 
 
 		 541 aa  85.5  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  24.49 
 
 		 551 aa  82  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  26.11 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  25.99 
 
 		 533 aa  70.1  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  29.86 
 
 		 307 aa  70.1  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  27.62 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.05 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  27.22 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  29.27 
 
 		 296 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  26.15 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  29.27 
 
 		 296 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  29.27 
 
 		 296 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  28.92 
 
 		 275 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  26.84 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  25.19 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.93 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  26.63 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  28.47 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  28.47 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  30.37 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  27.72 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  28.03 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  29.13 
 
 		 287 aa  63.9  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  27.89 
 
 		 753 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  26.28 
 
 		 278 aa  63.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  25.99 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  29.71 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  29.63 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  31.85 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  24.54 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  35.29 
 
 		 304 aa  62  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  31.21 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  26.26 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  28.41 
 
 		 275 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  30.08 
 
 		 288 aa  60.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  25.58 
 
 		 277 aa  60.1  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  29.2 
 
 		 286 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  22.11 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  34.15 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  29.2 
 
 		 286 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  30.15 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  29.69 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  23.78 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  23.86 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  28.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  22.51 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  28.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  28.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  28.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  28.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  28.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  28.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  27.22 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  28.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  28.89 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  28 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  29.41 
 
 		 286 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  22.98 
 
 		 528 aa  57.4  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  26.56 
 
 		 308 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  30.37 
 
 		 289 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  57  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  24.85 
 
 		 275 aa  56.6  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  26.95 
 
 		 275 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  25.63 
 
 		 551 aa  56.2  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  27.67 
 
 		 312 aa  55.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  29.6 
 
 		 326 aa  55.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  28.89 
 
 		 286 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>