99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0932 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  100 
 
 
551 aa  1103    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  56.98 
 
 
548 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  57.56 
 
 
551 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  50.36 
 
 
544 aa  467  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  44.63 
 
 
516 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  38.18 
 
 
502 aa  290  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  32.73 
 
 
533 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  30.02 
 
 
558 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.46 
 
 
490 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  31.89 
 
 
607 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.49 
 
 
541 aa  136  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  28.33 
 
 
517 aa  131  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  28.66 
 
 
510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  28.47 
 
 
524 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  28.35 
 
 
551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  29.85 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  26.33 
 
 
514 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  26.33 
 
 
514 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  26.61 
 
 
514 aa  101  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  27.64 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  27.22 
 
 
500 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  33.73 
 
 
307 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  26.16 
 
 
514 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  35.5 
 
 
203 aa  98.2  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  31.42 
 
 
334 aa  97.8  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  26.8 
 
 
514 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  27.36 
 
 
517 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  26.37 
 
 
516 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  25.23 
 
 
471 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  35.8 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  26 
 
 
842 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.63 
 
 
248 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  31.29 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  25.48 
 
 
830 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  29.11 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  29.82 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  30.16 
 
 
974 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  24.9 
 
 
876 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  25.51 
 
 
844 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  30.25 
 
 
308 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  24.1 
 
 
1079 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  24.4 
 
 
1078 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  24.19 
 
 
1078 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  29.65 
 
 
188 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  31.9 
 
 
310 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  32.56 
 
 
316 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  24 
 
 
749 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  25.81 
 
 
982 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  26.58 
 
 
759 aa  58.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
304 aa  57.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  30.05 
 
 
296 aa  57.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  24.55 
 
 
758 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  25.85 
 
 
835 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  25.35 
 
 
836 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  22.17 
 
 
508 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  33.04 
 
 
261 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  28.65 
 
 
315 aa  54.3  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  24.37 
 
 
1017 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  26.67 
 
 
247 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  27.78 
 
 
520 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  25.93 
 
 
837 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  29.21 
 
 
307 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  25.77 
 
 
523 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  30.49 
 
 
983 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  28.86 
 
 
757 aa  50.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  32.46 
 
 
283 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  36.84 
 
 
304 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  28.33 
 
 
310 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  27.25 
 
 
520 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  25.15 
 
 
264 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  25.15 
 
 
264 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  27.25 
 
 
520 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  23.98 
 
 
308 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  28 
 
 
735 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  32.2 
 
 
284 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  30.67 
 
 
280 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  30.97 
 
 
259 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  28.15 
 
 
705 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  23.56 
 
 
504 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  29.08 
 
 
705 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  38.37 
 
 
759 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  24.38 
 
 
247 aa  45.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  26.35 
 
 
349 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  24 
 
 
283 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  29.37 
 
 
320 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  27.46 
 
 
258 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  31.58 
 
 
759 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  28.57 
 
 
326 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  29.47 
 
 
991 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  32.14 
 
 
314 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  24.56 
 
 
252 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  29.37 
 
 
320 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  31.58 
 
 
759 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  24.55 
 
 
247 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  24.55 
 
 
247 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  25.79 
 
 
251 aa  43.9  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  36.47 
 
 
475 aa  43.9  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  36.05 
 
 
759 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>