118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2880 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2880  spermidine synthase  100 
 
 		 494 aa  1006    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.548533 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  24.69 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  24.58 
 
 		 837 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  23.52 
 
 		 1078 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1079 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  23.67 
 
 		 1078 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.9 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  23.61 
 
 		 1017 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  24.55 
 
 		 876 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  27.39 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  22.65 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  22.69 
 
 		 1040 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  23.38 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  26.75 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  29.83 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  26.79 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  29.41 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  32.56 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  24.73 
 
 		 835 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  25.93 
 
 		 313 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  29.46 
 
 		 280 aa  57  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  31.01 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  25.95 
 
 		 286 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  21.02 
 
 		 533 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  25.58 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  25.58 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1194  spermidine synthase  28.83 
 
 		 285 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  28.75 
 
 		 307 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  27.52 
 
 		 279 aa  55.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  20.34 
 
 		 782 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  30.23 
 
 		 283 aa  54.7  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  21.9 
 
 		 983 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  19.3 
 
 		 508 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  25.95 
 
 		 314 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  21.72 
 
 		 982 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  31.25 
 
 		 280 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  21.33 
 
 		 749 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  31.25 
 
 		 280 aa  53.9  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  26.67 
 
 		 289 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  24.85 
 
 		 312 aa  53.9  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2470  spermidine synthase  24.23 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3468  spermidine synthase  24.23 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0390  spermidine synthase  28.83 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1250  spermidine synthase  24.23 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  27.41 
 
 		 289 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3433  spermidine synthase  24.23 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3470  spermidine synthase  24.23 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3315  spermidine synthase  24.23 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  30.47 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  31.25 
 
 		 280 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  29.6 
 
 		 286 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  27.56 
 
 		 310 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  25.06 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  23.71 
 
 		 836 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  27.21 
 
 		 286 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  28.18 
 
 		 285 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  28.57 
 
 		 286 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0561  spermidine synthase  28.44 
 
 		 285 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  23.03 
 
 		 283 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  25.38 
 
 		 283 aa  51.2  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  28.57 
 
 		 286 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  28.03 
 
 		 287 aa  50.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2749  spermidine synthase  25.6 
 
 		 295 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.53231 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  25 
 
 		 326 aa  50.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  25.78 
 
 		 286 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  25.78 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  25.78 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  23.17 
 
 		 844 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  25.78 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  24.69 
 
 		 303 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  25.78 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  25.78 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  23.03 
 
 		 283 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  25.78 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  25.78 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  25.78 
 
 		 286 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  25.78 
 
 		 286 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  25.78 
 
 		 286 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  25.78 
 
 		 286 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  25.78 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3721  spermidine synthase  27.52 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0154  spermidine synthase  28.7 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  24.09 
 
 		 308 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0637  spermidine synthase  28.7 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  23.61 
 
 		 304 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21581  spermidine synthase  28.39 
 
 		 288 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  24.12 
 
 		 991 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  24.26 
 
 		 842 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  25.68 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0604  spermidine synthase  28.7 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  26.97 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  26.47 
 
 		 286 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  24.22 
 
 		 289 aa  47.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  26.81 
 
 		 279 aa  47.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  25.74 
 
 		 286 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  26.19 
 
 		 296 aa  47  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  25.77 
 
 		 283 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  26.19 
 
 		 296 aa  47.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  26.19 
 
 		 296 aa  47.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  25 
 
 		 288 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>