224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2138 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1083    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  35.98 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  32.93 
 
 		 502 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  33.08 
 
 		 548 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  34.74 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  31.04 
 
 		 551 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  42.77 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  31.91 
 
 		 551 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.02 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  31.07 
 
 		 558 aa  170  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  28.85 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  26.38 
 
 		 517 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.56 
 
 		 541 aa  148  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  27.89 
 
 		 524 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  26.05 
 
 		 607 aa  136  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  25.95 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  23.54 
 
 		 500 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  38.38 
 
 		 203 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  22.7 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  22.81 
 
 		 517 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  23.66 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  22.91 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  22.09 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  23.46 
 
 		 514 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  24.4 
 
 		 514 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  24.25 
 
 		 514 aa  103  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  23.2 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  24.24 
 
 		 1078 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  24.4 
 
 		 1078 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1079 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  24.84 
 
 		 471 aa  94  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  35.54 
 
 		 220 aa  93.6  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.62 
 
 		 307 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.62 
 
 		 248 aa  86.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  28.11 
 
 		 974 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  27.63 
 
 		 749 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  24.89 
 
 		 311 aa  76.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  28.57 
 
 		 255 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  28.44 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  24.43 
 
 		 835 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  28.11 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  22.51 
 
 		 1017 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  29.73 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  31.15 
 
 		 759 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  21.18 
 
 		 876 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  22.2 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  24.12 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  31.15 
 
 		 759 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  26.02 
 
 		 705 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  28.14 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  32.73 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  28.86 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  24.62 
 
 		 844 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  26.28 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  23.57 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  25.21 
 
 		 735 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  22.92 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  30.58 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.66 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  27.4 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  33.02 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  21.52 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  21.05 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  25.69 
 
 		 276 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  27.74 
 
 		 277 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  21.19 
 
 		 803 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  28.48 
 
 		 188 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  25.69 
 
 		 284 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  26.17 
 
 		 269 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  29.51 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  24.61 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  26.63 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  25.93 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  27.82 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  27.52 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  27.52 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  22.63 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  28.57 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  24.26 
 
 		 674 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  29.08 
 
 		 760 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  25.93 
 
 		 247 aa  57  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  27.1 
 
 		 231 aa  57  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  28.45 
 
 		 304 aa  57  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.57 
 
 		 278 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  25.35 
 
 		 287 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  28.57 
 
 		 286 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  21.54 
 
 		 830 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  27.51 
 
 		 247 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  27.7 
 
 		 248 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  31.78 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  21.6 
 
 		 837 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  25.6 
 
 		 272 aa  55.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  27.45 
 
 		 247 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  27.45 
 
 		 247 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  33.55 
 
 		 558 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  28.7 
 
 		 289 aa  54.7  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  27.45 
 
 		 261 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  27.45 
 
 		 261 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>