273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0936 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  100 
 
 		 516 aa  1050    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  45.71 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  44.63 
 
 		 551 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  43.67 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  43.45 
 
 		 548 aa  363  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  40.63 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  36.11 
 
 		 533 aa  287  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  33.12 
 
 		 558 aa  224  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  32.11 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.31 
 
 		 541 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  32.14 
 
 		 517 aa  170  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  28.76 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  29.13 
 
 		 607 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  28.23 
 
 		 551 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  26.73 
 
 		 524 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  33.22 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  26.4 
 
 		 514 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  26.54 
 
 		 514 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  25.57 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  35.5 
 
 		 203 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  26.83 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  25.77 
 
 		 514 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  25.1 
 
 		 514 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  26.69 
 
 		 500 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  27.1 
 
 		 516 aa  113  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  25.29 
 
 		 517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  26.14 
 
 		 517 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  35.03 
 
 		 220 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  30.28 
 
 		 307 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  39.29 
 
 		 248 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  30.26 
 
 		 311 aa  95.9  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  27.09 
 
 		 749 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  24.34 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  31.44 
 
 		 974 aa  89.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  23.46 
 
 		 1078 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  23.22 
 
 		 1078 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1079 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  23.59 
 
 		 782 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  25.83 
 
 		 830 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  26.35 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  27.75 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  33.96 
 
 		 255 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  30.68 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  26.56 
 
 		 842 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  24.68 
 
 		 835 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  24.18 
 
 		 844 aa  67.4  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  31.76 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  30.63 
 
 		 316 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  24.02 
 
 		 758 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  26.67 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  30.41 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  22.87 
 
 		 1017 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  27.16 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  29.08 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  27.96 
 
 		 280 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2880  spermidine synthase  25.1 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.548533 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  26.54 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  34.26 
 
 		 221 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  31.72 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  31.41 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  22.19 
 
 		 705 aa  60.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  31.72 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  34.78 
 
 		 759 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  34.21 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  26.67 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  22.19 
 
 		 705 aa  60.1  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  30.34 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  26.25 
 
 		 280 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  22.69 
 
 		 876 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  26.67 
 
 		 278 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  28.26 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  24.55 
 
 		 759 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  26.14 
 
 		 279 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  29.65 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  28.49 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  26.7 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  25 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  26.97 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  27.27 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  22.82 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  24.07 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  22.6 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  26.7 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  26.4 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  30.84 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  26.46 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  33.63 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  23.33 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  23.14 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  22.4 
 
 		 837 aa  57.4  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  26.63 
 
 		 308 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  26.63 
 
 		 308 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  25.35 
 
 		 326 aa  57  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  30.2 
 
 		 283 aa  57  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  29.36 
 
 		 267 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  25.06 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  24.83 
 
 		 264 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>