More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1257 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1257  transferase  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  93.07 
 
 		 284 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  93.07 
 
 		 276 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  92.64 
 
 		 269 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  58.08 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  53.24 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  54.13 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  54.63 
 
 		 278 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  54.63 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  52.31 
 
 		 278 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  50.45 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  48.66 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  48.66 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  52.28 
 
 		 239 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  48.6 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  48.6 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  50.28 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  50.28 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  46.79 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  49.46 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  48.07 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  48.09 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  44.19 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  41.86 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  48.9 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  43.54 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  35.81 
 
 		 289 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  48.99 
 
 		 275 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  37.27 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  31.63 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  35.27 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  36.27 
 
 		 306 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  31.6 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  36.27 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.19 
 
 		 308 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  34 
 
 		 305 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  34.15 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  33.17 
 
 		 291 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  34.07 
 
 		 310 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  32.99 
 
 		 310 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  34.8 
 
 		 310 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  28.42 
 
 		 311 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  32.77 
 
 		 364 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  32.02 
 
 		 305 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  34.78 
 
 		 305 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  34.78 
 
 		 305 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  34.78 
 
 		 305 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  32.69 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  31.22 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  34.16 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  31.73 
 
 		 309 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  31.73 
 
 		 309 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  31.73 
 
 		 309 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  34.16 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  32.5 
 
 		 309 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  32.06 
 
 		 387 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  33.54 
 
 		 305 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  30.19 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  32.84 
 
 		 387 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  32.5 
 
 		 398 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  31.1 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  35.14 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  33.53 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  34.02 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  32.99 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  33.66 
 
 		 283 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  28.3 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  33.95 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  30.16 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  33.99 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  31.48 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  27.96 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  32.58 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  26.34 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.01 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  41.8 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  31.2 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  34.24 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  29.85 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  31.2 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  32.82 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  35.95 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  30.35 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  30.66 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  30.19 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  33.87 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  28.64 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  33.09 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  33.09 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  30.15 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  30.37 
 
 		 365 aa  68.6  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  29.15 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  30.9 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  34.45 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  35.12 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.81 
 
 		 558 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  25.23 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0502  hypothetical protein  31.87 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  28.41 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  24.77 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>