243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1722 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  37.71 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  37.71 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  37.45 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  41.55 
 
 		 261 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  37.92 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  36.55 
 
 		 271 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  37.34 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  35.54 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  41 
 
 		 253 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  37.7 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  39.19 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  34.44 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  41.62 
 
 		 235 aa  162  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  41.62 
 
 		 235 aa  162  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  40.67 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  40.67 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  38 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  39.71 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  39.71 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  39.3 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  36.52 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  39.71 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  35.78 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  35.08 
 
 		 269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  34.23 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  34.68 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  34.68 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  35.81 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  36.56 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  36.56 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  36.56 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  36.56 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  36.56 
 
 		 387 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  36.56 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  36.56 
 
 		 398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  35.19 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  36.12 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  34.16 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  33.05 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  35.09 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  35.09 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  33.48 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  34.04 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  37.24 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  37.24 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  37.24 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  32.62 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  32.5 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  35.16 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  34.87 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  37.17 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  35.16 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  29.22 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  33.62 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  32.02 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  33.5 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  33.19 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  33.62 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  31.78 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  32.92 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  31.33 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  35.15 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  34.78 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  32.68 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  32.68 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  32.85 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  30.04 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  28.07 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  30.93 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.94 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  30.41 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  30.41 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  30.41 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  30.24 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  28.93 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  30.39 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  30.64 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  30.41 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  33.12 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  26.27 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  29.38 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  28.77 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  29.9 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.94 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  31.61 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  29.9 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  29.9 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  32.72 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  29.9 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  30.56 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  27.45 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  30.97 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  32.05 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  32.05 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  32.05 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  30.97 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  32.05 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  26.8 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  30.58 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>