More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4320 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  100 
 
 		 311 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  36.68 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  34.38 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  28.98 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  29.63 
 
 		 558 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  30 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  27.12 
 
 		 255 aa  96.3  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  30.26 
 
 		 516 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.59 
 
 		 541 aa  95.9  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  28.42 
 
 		 231 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  30.43 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  28.16 
 
 		 551 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.04 
 
 		 278 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  32.9 
 
 		 284 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  27.94 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  28.87 
 
 		 264 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  29.23 
 
 		 281 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  28.87 
 
 		 264 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  30.32 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  25.99 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  28.42 
 
 		 271 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30 
 
 		 490 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  27.32 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  30.22 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  27.32 
 
 		 269 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  27.32 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  30.61 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  27 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  30.73 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  26.07 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  30.43 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  30.43 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  27.84 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  29.05 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  25.7 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  27.78 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  26.97 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  25 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  27.35 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  24.89 
 
 		 533 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  24.24 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  27.51 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  29.35 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  25.48 
 
 		 607 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  27.67 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  28.8 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  28.8 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  27.06 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  27.8 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  26.04 
 
 		 514 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  30.68 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  27.14 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  26.37 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  28.98 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  23.89 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  26.64 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.21 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  26.44 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  29.82 
 
 		 551 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  26.04 
 
 		 514 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  25.31 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  29.66 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  26.29 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  26.56 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  25.98 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  28.81 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  24.4 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  25.14 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  26.79 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  25.98 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  25.98 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  23.42 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  26.59 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  28.48 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  33.15 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  26.79 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  27.78 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  29.55 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  25.76 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  27.35 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  23.59 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  24.92 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  27.33 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  27.22 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  27.22 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2384  spermidine synthase-like protein  32.39 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  27.22 
 
 		 247 aa  67  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  27.27 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  24.26 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  27.08 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  24.49 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  23.79 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1760  hypothetical protein  30.22 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1532  putative spermidine synthase  30.23 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218383  normal  0.14893 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  26.4 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  26.67 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  24.65 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  35.78 
 
 		 678 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>