164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2501 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  78.57 
 
 		 253 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  30.38 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  33.47 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  35.11 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  31.8 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  31.8 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  31.8 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  31.8 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  32.86 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  30.43 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  28.63 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  30.25 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  27.78 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.88 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  28.03 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  28.21 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  28.03 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  27.78 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  34.91 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  30 
 
 		 281 aa  99  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  29.22 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  29.76 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  30 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  30 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  29.76 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  29.88 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  29.6 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  27.31 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  26.91 
 
 		 291 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  30.39 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  30.28 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  31.71 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  26.64 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  29.79 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  29.3 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  30.97 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  30.97 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  30 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  27.39 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  27.75 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  27.32 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  26.29 
 
 		 364 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  25.85 
 
 		 305 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  25.85 
 
 		 305 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  25.69 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  25.69 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  25.69 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  25.69 
 
 		 387 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  26.64 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  26.64 
 
 		 310 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  25.85 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  32.4 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  25.3 
 
 		 309 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  25.3 
 
 		 387 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  27.91 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  25.3 
 
 		 398 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  25.85 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  26.05 
 
 		 259 aa  85.1  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0828  spermine synthase  31.33 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  25.85 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  25.96 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  25.85 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  25.85 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0791  spermine synthase  31.21 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  31.69 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  25.85 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  25.11 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  30.34 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  25.2 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2384  spermidine synthase-like protein  31.9 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0502  hypothetical protein  29.19 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  26.27 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  26.2 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  25.84 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  25.84 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  29.06 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  25.84 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  25.65 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  24.68 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  25.65 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  25.64 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  25.55 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  25.65 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  27.11 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  27.11 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  25.22 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  23.97 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  27.75 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  26.34 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  30.09 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  27.43 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  25.81 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  25.81 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  24.89 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  26.37 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  24.24 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>