191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1235 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  100 
 
 
267 aa  553  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  41.5 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  36.07 
 
 
255 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  37.99 
 
 
275 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  39.75 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  33.99 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  37.17 
 
 
277 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  38.36 
 
 
253 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  34.54 
 
 
310 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  38.25 
 
 
255 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  33.06 
 
 
259 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  34 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  34.23 
 
 
289 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  33.74 
 
 
291 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  36.09 
 
 
257 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  33.48 
 
 
264 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  33.33 
 
 
278 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  33.48 
 
 
264 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  33.47 
 
 
291 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  31.95 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  34.47 
 
 
305 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  32.64 
 
 
305 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  34.47 
 
 
305 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  34.47 
 
 
305 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  33.47 
 
 
295 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  33.76 
 
 
364 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  33.19 
 
 
271 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  32.34 
 
 
310 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  35.84 
 
 
261 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  33.33 
 
 
398 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  33.33 
 
 
387 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  33.62 
 
 
305 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  32.91 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  32.91 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  32.91 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  31.25 
 
 
306 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  38.12 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  39.46 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  31.6 
 
 
274 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  32.2 
 
 
278 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  32.2 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  32.24 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  31.84 
 
 
284 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  33.75 
 
 
255 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  31.84 
 
 
276 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  36.17 
 
 
278 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  36.17 
 
 
278 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  32.62 
 
 
235 aa  121  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  32.62 
 
 
235 aa  121  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  29.51 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  35.32 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  35.74 
 
 
254 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  31.43 
 
 
269 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  33.63 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  31.63 
 
 
231 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  35.19 
 
 
253 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  35.19 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  28.89 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  33.99 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  33.2 
 
 
255 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  30.86 
 
 
365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  30.93 
 
 
273 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  30.42 
 
 
307 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  32.49 
 
 
270 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  32.24 
 
 
268 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  26.64 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  27.27 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  28.45 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  28.02 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  27.01 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1668  hypothetical protein  31.66 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  31.25 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  25.32 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  25.93 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  26.52 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  26.96 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  26.52 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  26.52 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  25.32 
 
 
247 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  25.32 
 
 
247 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  28.11 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.78 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  26.39 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1674  hypothetical protein  31.16 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  22.71 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  26.25 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  26.25 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  26.64 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  25.21 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  24.06 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  28.5 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  25.43 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  30.67 
 
 
558 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  27.4 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>